山羊IGFBP-5 基因克隆及特征分析

河南农业科学 ›› 2011, Vol. 40 ›› Issue (6): 132-137.

山羊IGFBP-5 基因克隆及特征分析

李利, 李秋, 王林杰, 张红平^*

四川农业大学动物遗传育种研究所, 四川雅安 625014

收稿日期:2011-03-15 出版日期:2011-06-15 发布日期:2011-06-15
通讯作者: 张红平(1970-), 男, 四川平昌人, 教授, 博士, 主要从事羊的遗传育种与繁殖学研究。E-mail:zhp@sicau.edu.cn
作者简介:李利(1972-), 女, 重庆北碚人, 副教授, 博士, 主要从事羊的遗传育种与繁殖学研究。E-mail:lilyzh002@sohu.com
基金资助:
四川省教育厅重点项目(08ZA077);四川省科技支撑计划项目(2011NZ0003)

Received:2011-03-15 Published:2011-06-15 Online:2011-06-15

摘要/Abstract

摘要： 为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点。结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819 bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392 kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外。二级结构以无规卷曲为主(83.8%),α-螺旋和延伸片段分别为13.6%和2.6%。N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK 4种。山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89%和94%以上,其N-端在几个物种中完全一致。山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3)。山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素。

关键词: 南江黄羊, IGFBP-5基因, 克隆, 生物信息学分析

李利, 李秋, 王林杰, 张红平. 山羊IGFBP-5 基因克隆及特征分析[J]. 河南农业科学, 2011, 40(6): 132-137.

[1]	魏蔷, 李青梅, 金前跃, 宋亚鹏, 白怡霖, 张改平. 鸡减蛋综合征病毒中和性单克隆抗体的制备、鉴定及在双抗体夹心ELISA 中的应用[J]. 河南农业科学, 2024, 53(2): 128-135.
[2]	王川艺, 黄红涛, 陈发波, 郑张飞, 方平. 胭脂萝卜RsCHS1 基因克隆及表达分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(9): 122-132.
[3]	高文, 闫庚洋, 左俊凯, 许乐, 侯蕊利, 景其昌, 任昊. 蜀葵ArbHLH148 基因克隆与表达分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(9): 133-140.
[4]	姚帅涛, 吴文静, 王少瓷, 詹为民, 刘通, 姜良良, 杨建平. 玉米ZmHY5和ZmHY5L基因的克隆及其转录丰度对不同光质处理的响应[J]. 河南农业科学, 2023, 52(3): 26-35.
[5]	徐佳, 孙怀昌. 牛支原体Vsp 蛋白的原核表达及单克隆抗体的制备[J]. 河南农业科学, 2023, 52(12): 142-148.
[6]	杨翠凤, 滕峥, 韦春, 刘正鲁. 百香果苯丙氨酸解氨酶基因PePAL克隆及表达分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(10): 100-108.
[7]	白天亮, 李杰, 冉杰, 杨辉, 乔承彬, 李培富, 田蕾. 水稻产量构成因素QTL 精细定位的研究进展[J]. 河南农业科学, 2022, 51(8): 1-8.
[8]	罗俊, 党露, 郑鹿平, 刘金玲, 柴书军, 赵东, 杨艳艳, 滕蔓. 鸡异质核糖核蛋白AB单克隆抗体的制备及鉴定[J]. 河南农业科学, 2022, 51(2): 127-132.
[9]	王勋, 李鸽, 李青梅, 吕镕州, 孟泽锟, 柴书军, 杨继飞, 郭军庆, 张改平. 广谱性识别H7 亚型禽流感病毒HA 蛋白的单克隆抗体制备与鉴定[J]. 河南农业科学, 2022, 51(11): 119-126.
[10]	耿笑林, 孙杰, 王彦伟, 黄甜, 刘鹏, 曹红梅, 逄文强, 郝丽影, 邓均华, 黄玉欣, 田克恭. 非洲猪瘟病毒K145R 蛋白的原核表达及其单克隆抗体制备[J]. 河南农业科学, 2021, 50(8): 154-159.
[11]	孟继秋, 胡骁飞, 王耀, 邢云瑞, 曹金博, 陈琳琳, 孙亚宁, 张改平. 6-苄基腺嘌呤人工抗原的合成及鼠源多克隆抗体的制备[J]. 河南农业科学, 2021, 50(5): 157-164.
[12]	荣娜, 简思杰, 孙薇, 康超, 陈琛, 刘祥. 鱼类致病嗜水气单胞菌外膜蛋白TolC的原核表达及抗原性分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(3): 157-164.
[13]	杨立均, 鲁雅雯, 丁超, 金维环, 郭红祥. 烟草HPL基因的生物信息学分析与抗逆功能分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(2): 50-57.
[14]	颜世君, 郝丽影, 白露露, 郑丁丁, 宋欢欢, 李胜强, 王同燕, 谭菲菲, 邓均华, 田克恭. 非洲猪瘟病毒p22 蛋白的表达及单克隆抗体制备[J]. 河南农业科学, 2021, 50(12): 149-154.
[15]	刘运超, 杨苏珍, 陈玉梅, 王聚财, 尚延丽, 魏蔷, 陈维聪, 冯华, 张改平. 猪细小病毒中和性单克隆抗体的制备与鉴定[J]. 河南农业科学, 2021, 50(12): 155-162.

山羊IGFBP-5 基因克隆及特征分析

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics