猪细小病毒HNZM01株NS1基因的克隆及序列分析

河南农业科学 ›› 2012, Vol. 41 ›› Issue (3): 137-141.

猪细小病毒HNZM01株NS1基因的克隆及序列分析

郭东辉¹，王超群²，王建辉³，陈海宁¹，魏战勇^1*

1.河南农业大学牧医工程学院，河南郑州 450002；2.漯河出入境检验检疫局，河南漯河 462000；3.新安县职业高级中学，河南洛阳 471800

收稿日期:2011-09-13 出版日期:2012-03-15 发布日期:2012-03-15
通讯作者: 魏战勇（1975-），男，河南安阳人，副教授，博士，主要从事动物分子免疫学研究。E-mail：weizhanyong@henau.edu.cn
作者简介:郭东辉（1986-），男，河南新乡人，在读硕士研究生，研究方向：动物分子免疫学。E-mail：guodonghui0808@126.com
基金资助:
河南省杰出人才创新基金项目(0621002100)

Received:2011-09-13 Published:2012-03-15 Online:2012-03-15

摘要/Abstract

摘要： 为加强猪细小病毒病的监控,对分离的猪细小病毒(PPV)HNZM-01株NS1基因的序列进行了分析。设计一对特异性引物,以抽提的PPV HNZM-01株的DNA为模板,通过PCR反应扩增出大小约2.27kb的目的片段,并将其插入克隆载体pGEM-T Easy上,构建了重组质粒并测序。结果表明,NS1基因全长1 989bp,与预期目的片段大小一致。序列分析结果表明,PPV HNZM-01株的NS1基因与其他PPV毒株同源性在98.2%～99.8%,说明NS1基因具有高度保守性。同时应用ANTHEPROT软件分析了HNZM-01株NS1基因编码蛋白质的氨基酸组成和二级结构的含量、分布。结果表明,由于HNZM-01株中碱基的突变,造成其氨基酸序列与NADL-2株有所不同,形成的二级结构略有差异,但二级结构元件分布大致与NADL-2株相同。

关键词: 猪细小病毒, NS1基因, 克隆, 序列分析

郭东辉，王超群，王建辉，陈海宁，魏战勇. 猪细小病毒HNZM01株NS1基因的克隆及序列分析[J]. 河南农业科学, 2012, 41(3): 137-141.

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