猪圆环病毒2型的分离鉴定及其全基因组序列分析

河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (6): 117-121.

猪圆环病毒2型的分离鉴定及其全基因组序列分析

汪磊^1,2,赵宝磊²,冯华²,刘运超²,魏蔷²,张改平^1,2*

（1.河南农业大学牧医工程学院,河南郑州 450002； 2.河南省农业科学院动物免疫学重点实验室/农业部动物免疫学重点实验室,河南郑州 450002）

收稿日期:2018-01-10 出版日期:2018-06-15 发布日期:2018-06-15
作者简介:汪磊（1996-）,男,河南新蔡人,在读硕士研究生,研究方向：动物免疫学。E-mail：wanglei67896@163.com
基金资助:
河南省重点研发与推广专项（科技攻关）（182102110087）；国家重点研发计划项目（2016YFD0500704)

Received:2018-01-10 Published:2018-06-15 Online:2018-06-15

摘要/Abstract

摘要： 为分离鉴定流行于河南省的猪圆环病毒2型(PCV2),对河南省不同地区猪场的11份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征（PMWS）猪的病料进行分离鉴定,得到PCV2毒株。通过PCR检测,11份临床疑似病料中,7份确诊为PCV2阳性病料,阳性率为63.6%。挑选出阳性值较高的毒株命名为zmd-20161022,通过增殖培养筛选出优良毒株,并对其进行单层过氧化物酶试验（IPMA）鉴定,分析免疫原性；应用PCR对该病毒全基因组进行特异性扩增,经测序后对该病毒的同源性和系统进化进行分析。结果显示,该毒株序列全长1 767 bp,同源性分析发现与国内3株PCV2毒株（AY686763、HM641752、HM038034）的同源性为95.2%~98.3%,与基因登录号为HM038030.1的同源性高达98.6%。系统进化树分析发现，zmd-20161022毒株与基因登录号为HM038030.1的亲缘关系很近,被鉴定为PCV2b-1c型,属于PCV2b的一种亚型。

关键词: 猪圆环病毒2型, 分离鉴定, IPMA, 全基因组, 序列分析

汪磊,赵宝磊,冯华,刘运超,魏蔷,张改平. 猪圆环病毒2型的分离鉴定及其全基因组序列分析[J]. 河南农业科学, 2018, 47(6): 117-121.

参考文献

参考文献:
［1］ Ge X,Wang F,Guo X,et al.Porcine circovirus type 2 and its associated diseases in China［J］.Virus Res,2012,164(1/2)：100-106.
［2］Guo L J,Lu Y H,Wei Y W,et al.Porcine circovirus type 2 (PCV2):Genetic variation and newly emerging genotypes in China［J］.Virol J,2010,7(1):273.
［3］郭抗抗,张彦明,张红,等.猪圆环病毒2型分离株优势基因型分析与检测［J］.中国预防兽医学报,2010,32(10)：808-811.
［4］〖JP3〗Kweon C H,Nguyen L T K,Yoo M S,et al.Differential recognition of the ORF2 region in a complete Genome sequence of porcine circovirus type 2(PCV2) isolated from boar bone marrow in Korea［J］.Gene,2015,569(2)：308-312.
［5］吴瑗,章红兵,王鑫炎,等.2007—2012 年浙江省及周边地区猪圆环病毒 2 型 (PCV2) 分子流行病学调查［J］.农业生物技术学报,2013, 21(4)：456-463.
［6］Zhang D,He K,Wen L,et al.Genetic and phylogenetic analysis of a new porcine circovirus type 2(PCV2) strain in China［J］.Arch Virol,2015,160(12)：3149-3151.
［7］Kekarainen T,Mccullough K,Fort M,et al.Immune responses and vaccineinduced immunity against porcine circovirus type 2［J］.Veterinary Immunology and Immunopathology,2010,136(3)：185-193.
［8］郎洪武,陈晓春,吴华伟,等.猪圆环病毒病及其生物制品学的研究进展［J］.中国兽医科学,2012,42(5)：545-550.
［9］Takahagi Y,Nishiyama Y,Toki S,et al.Genotypic change of porcine circovirus type 2 on Japanese pig farms as revealed by restriction fragment length polymorphism analysis［J］.The Journal of Veterinary Medical Science,2008,70(6)：603-609.
［10］ Davies B,Wang X,Dvorak C M,et al.Diagnostic phylogenetics reveals a new porcine circovirus 2 cluster［J］.Virus Res,2016,217：32-37.
［11］董林,王艳萍,唐娜,等.猪圆环病毒2型基因型鉴别PCR检测方法的建立［J］.中国兽医科学,2013(10)：1073-1078.
［12］Yuan W,Li J,Zuo Y,et al.Complete genome sequence of porcine circovirus type 2 strain HBMC1［J］.Genome Announc,2014,2(6)：e00987-14.
［13］Shi J,Xu S,Fu F,et al.Phylogenetic analysis of 32 porcine circovirus type 2 isolates from Shandong,China ［J］.Arch Virol,2015,160(2)：465-468.
［14］李鹏,郭军庆,金前跃,等.猪圆环病毒2型荧光定量PCR检测方法的建立［J］.华北农学报,2014,29(2)：66-70.
［15］Alarcon P,Velasova M,Werling D,et al.Assessment and quantification of postweaning multi-systemic wasting syndrome severity at farm level［J］.Preventive Veterinary Medicine,2011,98(1)：19-28.

[1]	高文, 闫庚洋, 左俊凯, 许乐, 侯蕊利, 景其昌, 任昊. 蜀葵ArbHLH148 基因克隆与表达分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(9): 133-140.
[2]	赵文影, 张云静, 白小飞, 孙玉洁, 郭玲花, 黄柏成, 田克恭. 猪细小病毒BJ2 株的分离鉴定及全基因组序列分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(2): 136-144.
[3]	杨金初, 童治军, 李萌, 赵旭, 徐永明, 冯颖杰, 杨宗灿, 曲鹏, 李悦, 孙九喆, 张轲. 基于SNP 标记的4 个品种复烤烟叶鉴别研究[J]. 河南农业科学, 2023, 52(11): 174-180.
[4]	任春晓, 冯华, 张腾, 蒋敏, 刘运超, 金前跃, 张改平. 中和表位串联的PCV2b 病毒样颗粒在昆虫细胞中的表达与鉴定[J]. 河南农业科学, 2021, 50(7): 154-160.
[5]	徐引弟, 焦文强, 王治方, 李海利, 张青娴, 朱文豪, 王克领. 鸡滑液囊支原体河南株的分离鉴定与生物学特性研究[J]. 河南农业科学, 2021, 50(7): 168-173.
[6]	黄正阳, 陈宇婧, 黄克, 冷超粮, 刘阳坤, 姚伦广, 李娜. 猪A组轮状病毒HN2019-01株的分离鉴定及VP6基因序列分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(6): 125-133.
[7]	金前跃, 郭永刚, 李俊朋, 秦保亮, 王寅彪, 郭振华, 王丽, 邢广旭, 邓瑞广, 张改平. 鹅星状病毒XX株的分离鉴定及遗传特征分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(6): 134-141.
[8]	苏文文, 吴迪, 韩振诚, 李良良, 李苇洁, 任春光. 贵州猕猴桃果实腐烂病病原菌鉴定及分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(3): 97-102.
[9]	贾艳艳, 李琦, 王晓利, 牛俊辉, 毛静, 廖成水, 张昊恺, 张明亮. 貂源肺炎克雷伯菌的分离鉴定及胞外分泌蛋白的核酸酶活性分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(3): 142-147.
[10]	陈则东, 朱建平, 郭书玉, 卢炜, 刘蕾. 植物乳杆菌LR-39对犬的促生长及肠道菌群调节作用[J]. 河南农业科学, 2021, 50(3): 148-156.
[11]	王宪宗, 宋晶, 杨春娟. 虹鳟hif-1a 基因家族的拷贝数变异及分歧进化[J]. 河南农业科学, 2021, 50(11): 153-161.
[12]	都萃颖, 卢佳熠, 胡浪, 姚国新, 戴余军, 李静, 郑操. 土壤环境中可降解丙酸细菌的筛选和鉴定[J]. 河南农业科学, 2021, 50(10): 69-75.
[13]	鲍印, 翟洪月, 李慧敏, 袁志乔, 马玉静, 丁雨善, 阚云超, 姚伦广, 田志军, 冷超粮. 豫西南猪主要病毒性传染病流行病学调查[J]. 河南农业科学, 2021, 50(1): 152-157.
[14]	邓龙君. 大口黑鲈维氏气单胞菌的分离鉴定及其感染的病理损伤[J]. 河南农业科学, 2021, 50(1): 164-171.
[15]	任永康, 牛瑜琦, 逯成芳, 唐朝晖. 小麦Dof转录因子家族全基因组鉴定和表达分析[J]. 河南农业科学, 2020, 49(9): 11-19.