河南农业科学 ›› 2021, Vol. 50 ›› Issue (11): 153-161.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2021.11.018
王宪宗1,宋晶1,杨春娟2
WANG Xianzong1,SONG Jing1,YANG Chunjuan2
摘要: 为深入阐明虹鳟不耐低氧的分子机制,采用BLAST搜索、重构最大似然树来确定其hif-1a 家族的拷贝数,并对这些拷贝的组织表达谱、共表达基因及其所富集的GO条目、编码蛋白质的保守结构域分布及部分结构域的三维结构进行比较。结果显示,虹鳟的hif-1a 有2个拷贝,与它们直系同源的斑马鱼基因均是hif-1aa。2个hif-1a 拷贝的组织表达谱存在显著的分化,它们的共表达基因数量及所富集的与血管生成、细胞增殖、物质运输和代谢相关的GO条目数量也存在较大差异;它们所编码的蛋白质均拥有5个保守结构域,C-TAD结构域三维结构均存在结构创新,但bHLH结构域的三维结构存在较大差异。综上,虹鳟在较近的全基因组重复事件之前丢失了hif-1ab,现有的2个hif-1aa 拷贝在朝亚功能化方向快速进化,某些地理种群中可能已经存在有利于提高耐低氧性能的基因型。
中图分类号: