河南农业科学 ›› 2023, Vol. 52 ›› Issue (11): 174-180.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2023.11.019
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杨金初1,童治军2,李萌3,赵旭1,徐永明1,冯颖杰1,杨宗灿1,曲鹏3,李悦1,孙九喆1,张轲4
YANG Jinchu1,TONG Zhijun2,LI Meng3,ZHAO Xu1,XU Yongming1,FENG Yingjie1,YANG Zongcan1,QU Peng3,LI Yue1,SUN Jiuzhe1,ZHANG Ke4
摘要: 为探究单核苷酸多态性(SNP)标记在复烤烟叶品种鉴别上的可行性,开发基于SNP标记的复烤烟叶高效鉴别技术,对4个主栽烟草品种云烟87、红花大金元、K326及NC102的复烤烟叶进行了全基因组测序,应用全基因组数据发掘SNP位点,依据SNP位点设计了PCR引物,并对不同烟草品种进行了基因分型和区分。结果显示,4个品种复烤烟叶全基因组测序共获得21.5 Gb数据,共检测出27 137个SNP位点。挑选其中53个SNP位点设计不同错配类型等位基因引物570条,扩增结果均与预期一致。SNP位点35、45和51在品种间具有多态性,红花大金元在35、45、51位点基因型为T/T、C/C、T/T;K326为C/T、C/T、C/C;NC102为C/T、C/T、C/T;云烟87烟叶在35位点无扩增,在45、51位点的基因型为C/T、C/T。依据3个SNP位点的基因型构建不同品种的分子ID,可准确区分4个品种的复烤烟叶。
中图分类号: