猪ANXA2 基因多态性及组织表达差异分析

doi:10.15933/j.cnki.1004-3268.2022.02.014

河南农业科学 ›› 2022, Vol. 51 ›› Issue (2): 120-126.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2022.02.014

猪ANXA2 基因多态性及组织表达差异分析

卢鸿^1,2，李新荻^1,2，王宇^1,2，罗布白珍³，段梦琪^1,2，叶幼荣^1,2，张健^1,2，商鹏^1,2

（1.西藏农牧学院动物科学学院，西藏林芝 860000；2.西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心，西藏林860000；3.林芝市巴宜区畜牧兽医总站，西藏林860000）

收稿日期:2021-07-08 出版日期:2022-02-15 发布日期:2022-04-18
通讯作者: 商鹏（1984-），男，江苏常州人，副教授，博士，主要从事高原动物遗传资源保护与功能基因组研究。E-mail：nemoshpmh@126.com
作者简介:卢鸿（1996-），男，贵州织金人，在读硕士研究生，研究方向：动物遗传育种与繁殖。E-mail：lh02010901@163.com
基金资助:
西藏自治区“十四五”重大科技专项（XZ202101ZD0005N）；中央引导地方项目（YDZX20195400004426）；四川省区域创新合作
项目（2020YFQ0029）；中国农业大学基本科研业务费专项（2021TC002）

Analysis on the Polymorphism and Tissue Expression of ANXA2 Gene in Pigs

LU Hong^1,2，LI Xindi^1,2，WANG Yu^1,2，LUOBU Baizhen³，DUAN Mengqi^1,2，YE Yourong^1,2，ZHANG Jian^1,2，SHANG Peng¹，

（1.College of Animal Science，Tibet Agriculture and Animal Husbandry University，Linzhi 860000，China；2.Collaborative Innovation Center of Xizang Characteristic Agriculture and Animal Husbandry Resources Research and Development，Linzhi 860000，China；3.Animal Husbandry and Veterinary Station of Bayi District，Linzhi City，Linzhi 860000，China）

Received:2021-07-08 Published:2022-02-15 Online:2022-04-18

摘要/Abstract

摘要： 为了探究膜联蛋白A2(ANXA2)基因单核苷酸多态性（SNP）及其在组织中的表达差异，以180日龄的藏猪、大约克猪作为试验对象，检测ANXA2 基因在肝脏、腹脂和背脂组织上mRNA表达差异，并对ANXA2基因的5′侧翼区进行多态性分析。结果显示，在ANXA2基因5′侧翼区筛选到4个SNP位点，g.111574291G> A、g.111574499C>T、g.111574522G>C和g.111574638A>G，且藏猪与大约克猪等位基因频率差异显著（P<0.05）。在肝脏中，藏猪和大约克猪ANXA2基因的mRNA表达趋势基本一致；在背脂和腹脂中，藏猪ANXA2基因的mRNA表达量极显著低于大约克猪（P<0.01）。综上，ANXA2基因可能是调控脂肪沉积和脂肪代谢的重要候选基因。

关键词: ANXA2 基因, 藏猪, 大约克猪, 组织表达, 单核苷酸多态性

Abstract: In order to explore the single nucleotide polymorphism（SNP）of Annexin A2（ANXA2）gene and its expression differences in tissues，180‑day‑old Tibetan pigs and Yorkshire pigs were used as experimental objects to detect the mRNA expression difference of ANXA2 gene in liver，abdominal fat and dorsal fat tissus，and the polymorphism of 5′flanking region of ANXA2 gene was analyzed. The results showed that four SNP sites were screened in the 5′flanking region of ANXA2 gene，g.111574291G>A，g.111574499C>T，g.111574522G>C and g.111574638A>G. There was a significant difference in allele frequency between Tibetan pigs and Yorkshire pigs（P<0. 05）.In liver tissue，the mRNA expression trend of ANXA2 gene in Tibetan pigs and Yorkshire pigs was basically the same；In abdominal fat and dorsal fat tissus，the mRNA expression of ANXA2 gene in Tibetan pigs was significantly lower than that in Yorkshire pigs（P<0. 01）.In conclusion，ANXA2 gene may be an important candidate gene for regulating fat deposition and fat metabolism.

Key words: ANXA2 gene, Tibetan pig, Yorkshire pig, Tissue expression, SNP

中图分类号:

S828

卢鸿, 李新荻, 王宇, 罗布白珍, 段梦琪, 叶幼荣, 张健, 商鹏. 猪ANXA2 基因多态性及组织表达差异分析[J]. 河南农业科学, 2022, 51(2): 120-126.

LU Hong, LI Xindi, WANG Yu, LUOBU Baizhen, DUAN Mengqi, YE Yourong, ZHANG Jian, SHANG Peng. Analysis on the Polymorphism and Tissue Expression of ANXA2 Gene in Pigs[J]. Journal of Henan Agricultural Sciences, 2022, 51(2): 120-126.

图/表 6

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猪ANXA2 基因多态性及组织表达差异分析

Analysis on the Polymorphism and Tissue Expression of ANXA2 Gene in Pigs

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