河南农业科学 ›› 2009, Vol. 38 ›› Issue (8): 17-21.DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2009.08.004

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用SAM法分离谷子SSR位点的研究

贾小平1;王天宇2;黎裕2;宋燕春2;石云素2   

  1. 1河南科技大学农学院,河南洛阳471003;2中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 出版日期:2009-08-15 发布日期:2009-08-15
  • 基金资助:
    基金项目:国家自然科学基金项目(2005CCA02500;2005DIA4J019)

  • Published:2009-08-15 Online:2009-08-15

摘要: 首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中uniqueSSR106个,占所有SSR序列的65%,60个SSR序列的3’端成功设计特异引物,占uniqueSSR的56%。这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型。同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态性的消极影响等。

关键词: 谷子, 选择扩增微卫星法, SSR

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