牛BBOX1基因3′UTR变异体的克隆及其多态性分析

河南农业科学 ›› 2017, Vol. 46 ›› Issue (2): 120-123.

牛BBOX1基因3′UTR变异体的克隆及其多态性分析

宋雨霏，郭彦，辛友志，崔建伟，周国利^*

聊城大学生命科学学院,山东聊城 252059

收稿日期:2016-08-20 出版日期:2017-02-15 发布日期:2017-02-15
通讯作者: 周国利（1975-），男，内蒙古赤峰人，副教授，博士，主要从事动物遗传与功能基因遗传调控研究。E-mail:glzhou1975@163.com
作者简介:宋雨霏（1993-），女，山东菏泽人，在读硕士研究生，研究方向：生物化学与分子生物学。E-mail：448953745@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目（31571274）；山东省自然科学基金项目（ZR2015CM025）；聊城大学博士启动基金项目（31805）

Received:2016-08-20 Published:2017-02-15 Online:2017-02-15

摘要/Abstract

摘要： 为鉴定牛BBOX1基因选择性多聚腺苷酸化的不同变异体及其3′UTR的多态性，采用3′RACE的方法检测出BBOX1基因3个不同3′UTR全长的APA变异体，短APA变异体3′ UTR长度为229 bp，长APA变异体3′UTR长度分别为664 bp和678 bp。利用SSCP与测序相结合的方法，在BBOX1基因的3′UTR中检测到10个多态性，其中7个为SNP，分别为c.12T>C、c.100A>G、c.241T>C、c.480T>C、c.557T>C、c.606T>C和c.650T>C；3个为插入或缺失突变，分别为c.28_29insC、c.434_435delGT和c.512_513insTGC。SNP c.650T>C定位在Poly（A）加尾信号PAS3中，使加尾信号序列AAUAAA突变成AACAAA，导致3′ UTR长度为678 bp的变异体出现。

关键词: , 牛, BBOX1基因, 选择性多聚腺苷酸化, 多态性, 3&prime, UTR

宋雨霏，郭彦，辛友志，崔建伟，周国利. 牛BBOX1基因3′UTR变异体的克隆及其多态性分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(2): 120-123.

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