河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (8): 91-96.

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希金斯炭疽菌中5个典型septin的生物信息学分析

韩长志   

  1. 西南林业大学 林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南 昆明 650224
  • 收稿日期:2014-02-15 出版日期:2014-08-15 发布日期:2014-08-15
  • 作者简介:韩长志(1981-),男,河北石家庄人,讲师,博士,主要从事经济林病害生物防治与真菌分子生物学研究。E-mail:hanchangzhi@gmail.com
  • 基金资助:
    云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK11A101,ZK11SB01);云南省重点学科森林保护学科研项目(XKZ200905)

  • Received:2014-02-15 Published:2014-08-15 Online:2014-08-15

摘要: 希金斯炭疽菌可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给农业生产造成巨大的经济损失。septin是一个广泛存在于除植物以外其他生物的基因家族,其功能与细胞分裂、细胞内物质运输以及细胞周期的调控与细胞凋亡等关系密切,将成为新开发药物的潜在靶标。基于酿酒酵母中7个典型Septin蛋白的氨基酸序列,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对和关键词搜索,并通过SMART在线分析最终明确希金斯炭疽菌中含有5个典型的Septin。同时,从理化性质、跨膜区结构、二级结构以及亚细胞定位等方面对Septin进行生物信息学分析,结果显示,上述Septin均为亲水性蛋白,且不具有跨膜结构,其二级结构及亚细胞定位情况不同。 

关键词: 希金斯炭疽菌, septin, 生物信息学分析, 理化性质, 亚细胞定位, 二级结构