河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (8): 11-16.

• 作物栽培·遗传育种 • 上一篇    下一篇

小麦CBL4基因密码子使用特征分析

陈文烨1,2,焦义然1,2,杨军峰3,刘永伟2,杨 帆2,董福双2,王海波2,杜进民1*,周 硕2*   

  1. (1.河北科技大学 生物科学与工程学院,河北 石家庄 050000; 2.河北省农林科学院 遗传生理研究所/河北省植物转基因中心,河北 石家庄 050051; 3.河北旺丰种业有限公司,河北 邢台 054900)
  • 收稿日期:2018-01-18 出版日期:2018-08-15 发布日期:2018-08-15
  • 通讯作者: 周 硕(1985-),男,河北邢台人,副研究员,博士,主要从事生物技术方面的研究工作。 E-mail:zhoushuobio@163.com。杜进民同为通讯作者
  • 作者简介:陈文烨(1992-),女,河北保定人,在读硕士研究生,研究方向:植物分子生物学。E-mail:1148731631@qq.com
  • 基金资助:
    国家重点研发计划“七大作物育种”重点专项(2016YFD0101802);国家自然科学基金青年科学基金项目(31600216);河北省自然科学基金青年科学基金项目(C2017301066);河北省现代农业创新工程项目(494-0402-YBN-RDC4)

  • Received:2018-01-18 Published:2018-08-15 Online:2018-08-15

摘要: 采用CodonW和Usage Codon软件分析小麦CBL4基因密码子偏好性,并将其与其他17种不同目植物CBL4基因密码子偏好性进行比较,利用最小进化法分析多种植物的亲缘关系,以期为小麦CBL4基因改良以提高对干旱、低温和盐胁迫等逆境的抗性提供理论依据。结果表明,GC含量对小麦CBL4基因密码子偏好性具有重要的影响,小麦的G+C所占比例达58.0%,其中以第3位GC含量为主,而马铃薯对密码子的使用特征与小麦差异最大,形成鲜明的对比。小麦偏好使用CUC、AGG、UAA、AUC、GUG、GCG、ACG、UGC和GGC密码子,小麦等植物密码子偏好性结果与系统发育分析得出的亲缘关系结果一致。

关键词: 小麦, CBL4, 相对同义密码子使用度, 密码子偏好性