胡黄连GPPS基因的生物信息学分析

河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (6): 107-110.

胡黄连GPPS基因的生物信息学分析

郑雪，王慧娜^*，朱彦秋，丁卫凯，李娇娇，周延清，段红英^*

（河南师范大学生命科学学院，河南新乡 453000）

收稿日期:2018-01-16 出版日期:2018-06-15 发布日期:2018-06-15
通讯作者: 段红英（1977-），女，河南平舆人，教授，博士，主要从事植物遗传学工作。E-mail：dxdhy@163.com
作者简介:郑雪（1994-），女，河南许昌人，在读硕士研究生，研究方向：植物遗传学。E-mail：zhengxue_arron1120@qq.com。*同等贡献作者
基金资助:
国家自然科学基金（31500262）；河南省高校科技创新人才支持计划项目（17HASTIT034）

Received:2018-01-16 Published:2018-06-15 Online:2018-06-15

摘要/Abstract

摘要： 为了解胡黄连GPPS基因及其编码蛋白的生物学特性，并推测其功能，综合运用DNAMAN、MEGA6、Blast、Blastp和TMHMM Server等软件，分析了胡黄连GPPS基因序列及其编码蛋白的理化性质、结构域等，并对部分高等植物GPPS蛋白序列进行了比对和进化树构建。结果表明，胡黄连GPPS基因包含一个1 116 bp的开放阅读框（ORF），共编码371个氨基酸，编码蛋白为亲水性蛋白，很可能定位于叶绿体上，定位系数为6；金鱼草、小花茉莉GPPS基因编码蛋白与该蛋白相似度较高，分别为74%和77%。此外，空间结构分析和序列比对结果都表明，胡黄连GPPS基因编码蛋白与类异戊二烯合酶蛋白具有较高的相似度，推测胡黄连GPPS基因为植物萜类合成途径组分之一。

关键词: 胡黄连, GPPS基因, 生物信息学, 萜类物质

郑雪，王慧娜，朱彦秋，丁卫凯，李娇娇，周延清，段红英. 胡黄连GPPS基因的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2018, 47(6): 107-110.

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