河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (3): 75-80.

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土壤放线菌分离与16S rDNA系统发育分析

李永欣,张 栋,张晓瑜,郭立格,张利平*   

  1. 河北大学 生命科学学院/河北省微生物多样性研究与应用实验室,河北 保定 071001
  • 收稿日期:2013-11-08 出版日期:2014-03-15 发布日期:2014-03-15
  • 通讯作者: 张利平(1956﹣),女,河北保定人,教授,博士,主要从事微生物资源保护与利用及微生物遗传育种研究。E-mail:zhlping@hbu.edu.cn
  • 作者简介:李永欣(1986-),女,河北石家庄人,在读硕士研究生,研究方向:微生物资源保护与利用。E-mail:xin584548476@163.com
  • 基金资助:
     
    国家自然科学基金项目(30970010)

  • Received:2013-11-08 Published:2014-03-15 Online:2014-03-15

摘要: 为探讨燕山山脉土壤中可培养放线菌的物种多样性,建立该区域放线菌资源信息库,采用稀释涂布平板法对燕山山脉的26份土壤样品进行了放线菌的分离纯化,根据菌落表型共分离到1 055株分离物,并随机挑选其中200株进行初步鉴定。首先采用链霉菌属(Streptomyces)的特异引物对分离物DNA进行PCR扩增,从而快速鉴定分离物是否属于链霉菌属,然后对其余的分离物进行16SrDNA序列分析。结果表明,随机挑选的200株放线菌分属于19个属,其中哈马达菌属(Hamadaea)为我国首次报道。16SrDNA系统发育分析结果表明,菌株Y0450-41与哈马达菌属模式种的16SrDNA序列相似性为97.3%,是哈马达菌属的一个潜在新种;菌株Y0371-4与其系统发育关系最近已知种特殊链霉菌(Streptomyces specialis)的16SrDNA序列相似性为95.5%,可能代表着一个潜在的新属。 

关键词: 燕山山脉, 土壤, 放线菌, 16S rDNA