河南农业科学 ›› 2021, Vol. 50 ›› Issue (8): 146-153.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2021.08.017
郭振华1,邢广旭1,翁茂洋1,金前跃1,乔松林1,张改平1,2,3
GUO Zhenhua1,XING Guangxu1,WENG Maoyang1,JIN Qianyue1,QIAO Songlin1,ZHANG Gaiping1,2,3
摘要: 为了解我国伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)流行毒株遗传变异情况,对分离的2 株PRV(HeNLH/2017和HeNZM/2017)全基因组序列进行测定,并利用生物信息学方法进一步分析其遗传进化特征和主要保护性抗原的遗传变异情况。基因组测序结果显示,分离的2株PRV基因组全长约为143 kb,GC含量约为73.8%。遗传进化分析显示,2株PRV毒株与Bartha株、我国早期流行毒株Ea和Fa株以及2011年以来流行的变异毒株(HeN1和HN1201)核苷酸同源性分别为95.28%~95.37%、98.70%~98.80%和98.90%~99.42%。系统进化树显示,2株PRV分离株均属于基因2.2亚型(Genotype 2.2),且与变异毒株遗传关系更近。PRV主要抗原gB、gC和gD蛋白的氨基酸变异分析显示,与Bartha株相比,2株PRV 分离株以及我国其他PRV 流行毒株均发生了广泛的氨基酸变异,且有gB75SPG77的缺失、gC63AAASTPA69和gD278S/RPRP281 的插入;与我国早期流行毒株Ea和Fa相比,2株PRV分离株以及我国2011年以来流行的变异毒株的gB、gC和gD蛋白氨基酸序列同源性很高,仅在个别位点发生了突变。
中图分类号: