河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (11): 97-103.

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不同类型芥菜变种遗传差异的SSR分子标记检测

陈发波,方 平*,姚启伦,李先艳,陈小红   

  1. 长江师范学院 生命科学与技术学院,重庆 涪陵 408100
  • 收稿日期:2014-05-20 出版日期:2014-11-15 发布日期:2014-11-15
  • 通讯作者: 方 平(1965-),男,重庆石柱人,副教授,本科,主要从事作物遗传育种研究。E-mail:chenfabo963@aliyun.com
  • 作者简介:陈发波(1981-),男,四川冕宁人,副教授,博士,主要从事作物遗传育种研究。E-mail:chenfabo963@126.com
  • 基金资助:
    教育部春晖计划项目(Z2011143);重庆市教委科技计划项目(KJ121304);重庆市涪陵区科委计划项目(FLKJ,2012ABB1085)

  • Received:2014-05-20 Published:2014-11-15 Online:2014-11-15

摘要:  为了解不同类型芥菜变种间的遗传多样性,利用66对SSR引物对16份芥菜变种进行检测。结果表明,共扩出602个条带,多态性条带占92.5%,多态信息量(PIC)变幅为0.56~0.97,平均值为0.91。遗传相似系数为0.41~0.75,平均值为0.60,当相似系数为0.61时,可将供试材料分成4类。薹芥和抱子芥均单独为一类,第3类包括笋子芥、小叶芥和叶瘤芥,第4类包括白花芥、宽柄芥、长柄芥、大叶芥、凤尾芥、分蘖芥、卷心芥、茎瘤芥、花叶芥、结球芥和大头芥。表明16个芥菜变种间存在一定的遗传多样性。通过主成分分析也将供试材料分成4大类群,2种聚类分析结果基本一致,都说明来自相同省份的绝大部分材料聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律,但聚类结果与芥菜形态没有必然联系。 

关键词: 芥菜, 遗传多样性, SSR分子标记, 聚类分析, 主成分分析