豫西地区PRRSV新近流行株ORF5基因变异及Nsp2基因特征分析

河南农业科学 ›› 2012, Vol. 41 ›› Issue (1): 137-141.

豫西地区PRRSV新近流行株ORF5基因变异及Nsp2基因特征分析

张明亮¹，张春杰^1*，程相朝¹，赵星灿²，李银聚¹，吴庭才¹，李正¹，杨宁宁¹

1.河南科技大学动物科技学院，河南洛阳 471003；2.洛阳市动物疫病预防控制中心，河南洛阳 471002

收稿日期:2011-07-16 出版日期:2012-01-15 发布日期:2012-01-15
通讯作者: 张春杰（1964-），女，河南南召人，教授，博士，硕士生导师，主要从事动物疫病防控和分子免疫学研究。E-mail：cjzhang@sina.com
作者简介:张明亮（1985-），男，河南驻马店人，在读硕士研究生，研究方向：分子免疫学。E-mail：mingliang90909@163.com
基金资助:
洛阳市科技攻关项目(0801048A)

Received:2011-07-16 Published:2012-01-15 Online:2012-01-15

摘要/Abstract

摘要： 为研究豫西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)新近流行株ORF5基因的变异情况及Nsp2基因的结构特征,采用RT-PCR方法扩增了26份近期采自豫西地区猪场疑似PRRS猪肺脏样品中的ORF5全序列和Nsp2部分序列,并对其生物信息学和结构进行了分析。结果表明:成功扩增出的21株PRRSV流行株间ORF5全基因同源性为96.6%～100%,氨基酸同源性为97.5%～100%;与参考毒株JXA1、MLV、VR-2332和LV的核苷酸同源性分别为96.6%～98.9%、88.4%～89.2%、88.0%～89.5%和66.8%～67.3%;对阳性病料进行了部分Nsp2基因的扩增,测序结果显示,所有流行株的Nsp 2基因与已报道的美洲株VR-2332相比,不存在核苷酸的插入或突变,但存在2个位点共90个碱基的缺失;遗传衍化分析表明,流行毒株属于美洲型。研究结果揭示了豫西地区新近流行的PRRSV ORF5基因的变异情况及Nsp 2基因的特征,为该地区的PRRS防控工作提供了理论依据。

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒, 流行株, ORF5基因, Nsp2基因, 变异分析

张明亮，张春杰，程相朝，赵星灿，李银聚，吴庭才，李正，杨宁宁. 豫西地区PRRSV新近流行株ORF5基因变异及Nsp2基因特征分析[J]. 河南农业科学, 2012, 41(1): 137-141.

[1]	方剑玉, 张青娴, 郎利敏, 徐彬, 王改利, 席燕燕, 冯现明, 王克领, 李绍钰. 猪IFN-α8 的原核表达及抗猪繁殖与呼吸综合征病毒活性研究[J]. 河南农业科学, 2023, 52(9): 141-147.
[2]	张小霞, 杨艳青, 王秋云, 杜俊阳, 曹瀚文, 梁振普. 猪繁殖与呼吸综合征病毒感染Marc-145 细胞的长链非编码RNA 和mRNA 转录组分析[J]. 河南农业科学, 2023, 52(4): 127-136.
[3]	郭占达, 杜季梅, 郭子仪, 王新港, 张彦华. 2020 年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5 基因变异分析[J]. 河南农业科学, 2022, 51(3): 146-153.
[4]	石桃雄, 郑俊青, 黎瑞源, 吕丹, 陈庆富, 梁成刚. 苦荞种质资源种子蛋白质及组分含量的变异分析[J]. 河南农业科学, 2021, 50(9): 25-35.
[5]	周新宇, 陈鑫鑫, 乔松林, 郭振华, 李睿, 邓瑞广, 张改平. 猪繁殖与呼吸综合征病毒类NADC30毒株与JXA1-R疫苗株荧光定量PCR鉴别检测方法的建立及应用[J]. 河南农业科学, 2021, 50(1): 142-151.
[6]	鲍印, 翟洪月, 李慧敏, 袁志乔, 马玉静, 丁雨善, 阚云超, 姚伦广, 田志军, 冷超粮. 豫西南猪主要病毒性传染病流行病学调查[J]. 河南农业科学, 2021, 50(1): 152-157.
[7]	秦枫, 刘云, 吴植, 吴双, 郭长明, 顾玲玲, 吴晓洁, 朱善元. 蜘蛛香提取物体外抗猪繁殖与呼吸综合征病毒的作用[J]. 河南农业科学, 2020, 49(10): 149-155.
[8]	刘云, 朱善元, 龚祝南, 秦枫, 夏文龙, 吴双, 吴晓洁. 6种中药体外抗猪繁殖与呼吸综合征病毒的作用[J]. 河南农业科学, 2019, 48(10): 147-154.
[9]	方剑玉，朱文豪，郭小参，白献晓，李海利，徐引弟，郎利敏，王治方. 表达猪Viperin蛋白重组腺病毒的构建及其对PRRSV复制的抑制作用[J]. 河南农业科学, 2017, 46(9): 126-131.
[10]	崔丹丹，王傲杰，王新港，周峰，彭志锋，王川庆. 1株PRRSV类NADC30毒株的分离鉴定及序列分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(9): 132-138.
[11]	关淼，赵晓彤，曹东，顾贵波，杨本勇，李树博，申贯男，魏萍. 辽宁地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因的遗传变异分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(8): 137-141,146.
[12]	王林建，郭振华，乔松林，陈鑫鑫，张改平. 河南地区NADC30-like PRRSV毒株的增值特性与遗传进化分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(3): 122-128.
[13]	冯丽丽，燕照玲，陈海燕，段俊枝，孙怀昌. CD163分子对感染猪子宫内膜内皮细胞的影响[J]. 河南农业科学, 2017, 46(12): 130-133.
[14]	焦文强，白献晓，徐引弟，王克领，郎利敏，朱文豪，李海利，张青娴，张立宪，游一，王治方，许峰. 华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒变异分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(10): 128-131.
[15]	侯婕，李睿，马红芳，乔松林，张改平. 猪繁殖与呼吸综合征病毒入侵受体唾液酸黏附素的表达与纯化[J]. 河南农业科学, 2016, 45(3): 130-134.

豫西地区PRRSV新近流行株ORF5基因变异及Nsp2基因特征分析

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics