河南农业科学 ›› 2020, Vol. 49 ›› Issue (4): 138-146.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.04.020
周雍,魏磊,景炳年,马艳妮,王伟
ZHOU Yong,WEI Lei,JING Bingnian,MA Yanni,WANG Wei
摘要: 为了探讨猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)不同毒株致病性差异的原因,利用生物信息学在线软件比较PPV NADL-2株和Kresse株的非结构蛋白NS1的氨基酸位点差异,并利用一系列在线软件比较两者的氨基酸理化性质、亲水/疏水性、跨膜区、信号肽的异同,进一步分析两者的结构域、二级结构、三级结构的异同。结果表明,2种毒株在621—636位的氨基酸存在较大差异,Kresse株的疏水性较弱,且二级结构中Kresse株含较多的卷曲结构。经过三级结构比对,并结合以上结果推测,2种毒株致病性差异是由于621—636位未知功能的结构域不同所致。
中图分类号: