郑州地区2种菊花病毒CP基因的克隆与序列分析

doi:10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.02.016

河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (2): 77-84.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.02.016

郑州地区2种菊花病毒CP基因的克隆与序列分析

梁芳,刘瑞霞,张燕,王默霏,崔波,李静

1.郑州师范学院生物工程研究所，河南郑州 450044； 2.郑州师范学院生命科学学院，河南郑州 450044；3.山东省东营区实验学校，山东东营 257000

收稿日期:2017-06-27 出版日期:2018-02-15 发布日期:2018-02-15
通讯作者: 崔波（1962–），男，河南泌阳人，教授，博士，主要从事植物分子生物学研究。E-mail：laocuibo@163.com
作者简介:梁芳（1982–），女，湖北郧西人，讲师，博士，主要从事植物生物技术研究。E-mail：liangfang0801@163.com
基金资助:
郑州市重大科技专项（141PZDZX038）

Received:2017-06-27 Published:2018-02-15 Online:2018-02-15

摘要/Abstract

摘要： 为了探明郑州地区感病菊花上病毒的种类及来源，采集有明显病症的菊花样品，根据已知的番茄不孕病毒（TAV）和菊花B病毒（CVB）的基因序列设计特异性引物，采用RT-PCR扩增其外壳蛋白（CP）基因的方法对这2种病毒进行了检测，然后进行序列同源性及系统进化分析。结果显示，所得TAV的CP基因片段长度为481 bp，NCBI登录号为KU873003；所得3条CVB的CP基因片段长度均为547 bp，NCBI登录号分别为KU873004、KU873005、KU873006。将郑州分离物的CP基因与其他NCBI上已登录分离物进行比对，TAV核苷酸序列同源性为91%~99%，氨基酸序列同源性为86%~100%；CVB核苷酸序列同源性为76%~99%，氨基酸序列同源性为77%~99%。进化分析表明，菊花TAV郑州分离物与北京分离物KP019201、黑龙江分离物KP019202、河南分离物KP019200和山西分离物KP019204的亲缘关系最近；CVB郑州分离物与印度分离物AJ812569、AJ871367的亲缘关系最近。

关键词: 菊花, 番茄不孕病毒, 菊花B病毒, 外壳蛋白基因, 序列分析

中图分类号:

S436.8+1

梁芳,刘瑞霞,张燕,王默霏,崔波,李静. 郑州地区2种菊花病毒CP基因的克隆与序列分析[J]. 河南农业科学, 2018, 47(2): 77-84.

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