河南农业科学 ›› 2016, Vol. 45 ›› Issue (11): 105-109.

• 畜牧·兽医 • 上一篇    下一篇

4种主要RNA病毒病多重感染复合PCR检测方法的建立

刘 媛1,李学伍2,王 丽2,谷 雨3,王林建3   

  1. 1.河南科技大学 动物科技学院,河南 洛阳 471023; 2.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 450002; 3.河南农业大学 生物工程学院,河南 郑州 450002)
  • 收稿日期:2016-05-20 出版日期:2016-11-15 发布日期:2016-11-15
  • 作者简介:刘 媛(1991-),女,河南漯河人,在读硕士研究生,研究方向:分子病原学和免疫学。E-mail:862424624@qq.com
  • 基金资助:
    公益性行业(农业)科研专项(201303033)

  • Received:2016-05-20 Published:2016-11-15 Online:2016-11-15

摘要: 依据GenBank中注册的禽流感病毒(AIV)、鸡传染性支气管炎病毒(IBV)、新城疫病毒(NDV)和传染性法氏囊病毒(IBDV)基因组核苷酸序列,通过序列比对获得AIV、IBV、NDV、IBDV的相对保守序列。根据每种病毒的保守序列利用生物学软件分别设计3对特异性引物,4种病毒共设计12对引物,并对12对引物进行模拟筛选,获得匹配最佳的4对引物。对获得的最佳匹配引物进行单项PCR验证,优化复合PCR反应条件,确定最佳的退火温度、引物浓度和Taq DNA聚合酶使用量;经特异性、敏感性及简化PCR试验,最终建立了简易复合PCR检测方法。结果表明,建立的检测方法可同时扩增出4条大小与设计相符的特异性片段,即IBV(146 bp)、NDV(215 bp)、IBDV(345 bp)、AIV(435 bp);建立的复合PCR方法具有较强的敏感性和特异性,能检测出100 pg AIV、IBV、IBDV的cDNA和100 fg NDV的cDNA;将三温热循环改进为二温热循环,即将退火和延伸过程合为一步(62 ℃),大大缩短了反应时间。

关键词:  , 禽流感病毒, 鸡传染性支气管炎病毒, 新城疫病毒, 传染性法氏囊病毒, RNA病毒, 复合PCR