|
|
11种植物石细胞形成相关基因pal的生物信息学分析 |
靳 萍,靳同霞,赵青青,张 帆,张翔宇 |
河南师范大学 生命科学学院,河南 新乡 453007 |
|
|
摘要 植物石细胞是植物类药材显微鉴别的重要依据特征。为了从分子水平鉴定植物药材,采用生物信息学方法对NCBI数据库中登录的11种植物的石细胞形成相关基因pal的完整编码序列进行了比对、分析。结果显示:11种植物的pal基因的完全编码序列从1 619bp到2 626bp不等,开放阅读框(ORF)序列长度在1 380bp和2 178bp之间,有相同的起始密码子和不同的起始位点、终止位点和终止密码子。11种植物的pal的氨基酸序列具有一定的同源性,特别是在从810到2 200位点的氨基酸序列的同源性较高。不同物种的pal基因在进化过程中产生的多样性,可为pal基因用于植物药材鉴定提供依据。
|
|
关键词 :
石细胞,
pal基因,
生物信息学
|
收稿日期: 2011-10-13
|
基金资助: 河南省基础与前沿技术研究计划项目(082300453201) |
作者简介: 靳 萍(1969-),女,河南滑县人,实验师,主要从事植物生理生化等方面的研究。E-mail:jinping@htu.cn |
[1] |
郭玉琦,刘辰晖,刘桂琼,姜勋平,刘 耘. 鸡碳酸酐酶4的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2018, 47(5): 129-134. |
[2] |
钟 静,吴小明,胡 颖. 大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(3): 34-40. |
[3] |
李文旭,常 阳,杨 攀,王美芳,何盛莲,吴政卿,雷振生,晁岳恩. 郑麦366 α-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2017, 46(1): 13-18,25. |
[4] |
黄琼林,何 瑞,詹若挺. 青天葵PAL基因序列特征和表达分析[J]. 河南农业科学, 2016, 45(2): 104-108. |
[5] |
夏爱华,李季生,李 娜,贾漫丽,王 晖,杨贵明. 热激对家蚕后部丝腺磷酸化蛋白质组的影响[J]. 河南农业科学, 2016, 45(2): 127-133,137. |
[6] |
王振怡,王金朋,潘玉欣,张家琦,王希胤. 拟南芥和水稻CesA基因家族的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2015, 44(6): 13-17. |
[7] |
周明亮,杨平贵,吴登俊,张翔宇. 绵羊IGFBP–6基因的克隆及序列分析[J]. 河南农业科学, 2015, 44(4): 144-148. |
[8] |
郑英帅,左奕,柴瑞影,戚妍,李雅楠,袁万哲,孙继国. 猪博卡病毒NP1基因的克隆及其生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2015, 44(3): 148-151. |
[9] |
李丽莎,李祥龙,毛艳朋,吕彦英,郭伟婷. 山羊TRPM1基因CDS区生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2015, 44(12): 121-125. |
[10] |
鲁晓民,王振华,张新,张前进,魏昕. 玉米ZmHDR基因的分子克隆及生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(8): 14-19. |
[11] |
韩长志. 希金斯炭疽菌中5个典型septin的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(8): 91-96. |
[12] |
范小芳,王俊生,武安全,殷贵鸿,陈灿. 小麦DHAR基因的克隆及生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(7): 14-18. |
[13] |
兰俊,董德成,张雷,李安达,张传博. 灰葡萄孢菌Racl基因的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(6): 98-102. |
[14] |
马梦云,李祥龙,周荣艳,李兰会. 不同物种Mchr1基因编码区生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(5): 172-175. |
[15] |
胡慧艳,贾青,陶隽,魏星灿,陶文欢,墨锋涛,邢增喜. 家猪TBP蛋白结构与理化性质的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2014, 43(3): 128-132. |
|
|
|
|