河南农业科学 ›› 2019, Vol. 48 ›› Issue (8): 49-55.

• 作物栽培·遗传育种 • 上一篇    下一篇

铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析

兰晓天,胡 淞,冯 磊,田英男,和凤美   

  1. (云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明 650601)
  • 收稿日期:2019-03-18 出版日期:2019-08-15 发布日期:2019-08-15
  • 通讯作者: 和凤美(1964-),女,云南丽江人,教授,博士,主要从事植物育种研究。E-mail:hefengmei918@126.com
  • 作者简介:兰晓天(1995-),女,贵州兴义人,在读硕士研究生,研究方向:植物育种。E-mail:740006428@qq.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30860178)

  • Received:2019-03-18 Published:2019-08-15 Online:2019-08-15

摘要: 纤维素合成酶超级基因家族是植物体纤维素合成的重要基因。为研究铁皮石斛纤维素合成酶和类纤维素合成酶基因(CESA/CSL)家族的功能,利用从铁皮石斛转录组中鉴定出的32个在茎中高表达量的纤维素合成酶超级基因家族成员为研究对象,使用MEGA 5.0、GSDS、SMART、TMHMM、WoLF PSORT等软件对其构建系统进化树,并对基因结构及蛋白质保守结构域、跨膜结构和亚细胞定位等进行综合分析。结果显示,CESA/CSL基因在铁皮石斛不同组织中表达的数目和表达量均不同,具有组织表达特异性。铁皮石斛茎中表达量较高的CESA/CSL基因家族可分为6个亚族,外显子数目1~21个。CESA/CSL基因编码的蛋白质保守性较强,除CSLA亚族外,其余亚族均含有该基因家族的保守结构域Cellulose synthase。CESA/CSL蛋白主要分布于质膜上,大部分具有跨膜结构域。

关键词: 铁皮石斛, 纤维素合成酶超级基因家族, 生物信息学, 基因表达