河南农业科学 ›› 2020, Vol. 49 ›› Issue (8): 124-129.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.08.015
游敏芳1,2,3,吴磊1,2,3,廖朝美1,2,3,张依裕1,2,3,刘若余1,2,3,谭光辉1,2,3,李杰章1,2,3
YOU Minfang1,2,3,WU Lei1,2,3,LIAO Chaomei1,2,3,ZHANG Yiyu1,2,3,LIU Ruoyu1,2,3,TAN Guanghui1,2,3,LI Jiezhang1,2,3
摘要: 为了探究贵州特产长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域的多态性对蛋壳品质的影响,采用在线引物设计软件Primer Premier 3.0设计1对引物,扩增ITPR1基因RYDR-ITPR结构域,利用双向直接测序和序列比对法挖掘单核苷酸多态性(SNP)位点,应用SPSS 18.0软件分析SNP位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响。结果显示,在ITPR1基因第17~19内含子区共发现3个SNP位点,分别为位于18内含子上的g.18853584 G>T、g.18853600 A>G突变位点和19外显子上的g.18853848 C>T突变位点;3个SNP位点均为中度多态,均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),共检测到4种单倍型和7种双倍型。关联分析结果显示,位于19外显子上的g.18853848 C>T突变对蛋壳厚度有显著影响,TT、CC基因型显著高于TC基因型(P<0.05);双倍型H3H3的蛋壳厚度和蛋壳强度测定值最高。综上,长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域中g.18853848C>T突变可能是影响蛋壳厚度的标记位点,双倍型H3H3可能是蛋壳厚度和蛋壳强度的有利双倍型。
中图分类号: