河南农业科学 ›› 2019, Vol. 48 ›› Issue (7): 24-37.

所属专题: 逆境(激素)响应转录组分析专题

• 作物栽培·遗传育种 • 上一篇    下一篇

基于转录组测序的花生籽粒不同发育时期油脂合成相关基因差异表达分析

陈玉梅,李璐璐,陈锦玲,徐 媛,李惠敏,秦新民   

  1. (广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004)
  • 收稿日期:2019-01-23 出版日期:2019-07-15 发布日期:2019-07-15
  • 通讯作者: 秦新民(1956-),男,广西灵川人,教授,博士,主要从事植物分子生物学研究。E-mail:xmqin@mailbox.gxnu.edu.cn
  • 作者简介:陈玉梅(1990-),女,广西藤县人,在读硕士研究生,研究方向:植物分子生物学。E-mail:756827057@qq.com
  • 基金资助:
    广西研究生教育创新计划项目(XYCSZ2018056)

  • Received:2019-01-23 Published:2019-07-15 Online:2019-07-15

摘要: 为研究花生籽粒不同发育时期油脂合成过程中基因的表达调控模式,对花后20、35、50、60 d的花生籽粒(分别表示为HS20、HS35、HS50、HS60)进行转录组测序。通过对转录组测序数据进行分析,HS20、HS35、HS50、HS60样品的文库分别获得了109 321 068、106 867 224、109 313 082、107 123 540条Clean reads。将得到的花生籽粒转录组数据按发育时期的先后顺序进行两两比对,HS20-vs-HS35、HS35-vs-HS50和HS50-vs-HS60的差异表达基因总数分别是25 769、18 403、12 308个,其中上调表达基因分别占12.55%、62.92%、26.28%。对差异表达基因进行KEGG Pathway分析,得到135条代谢通路,其中与油脂合成相关的有脂肪酸生物合成、不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸延长、脂肪酸代谢、花生四烯酸代谢等代谢通路。

关键词: 花生, 转录组, 差异表达分析, 油脂合成相关基因