河南农业科学 ›› 2013, Vol. 42 ›› Issue (8): 16-20.

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籼粳亚种间琼脂糖凝胶电泳多态性SSR标记筛选与评价

姚国新1,2,卢磊1,但志武2,黄文超2   

  1. 1.湖北工程学院 生命科学技术学院,湖北 孝感 432000;2.武汉大学 生命科学学院,湖北 武汉 430072
  • 收稿日期:2013-05-25 出版日期:2013-08-15 发布日期:2013-08-15

  • Received:2013-05-25 Published:2013-08-15 Online:2013-08-15
  • About author: 湖北省教育厅重点项目(D20132704);湖北省自然科学基金项目(2012FFB00504);湖北工程学院博士科研启动基金项目(HE2010002)

摘要: 利用琼脂糖凝胶为电泳介质,籼稻9311和粳稻日本晴为模板,从756对SSR标记中筛选能够分辨多态性的标记用于籼粳亚种遗传研究。共筛选到176对SSR标记,其在籼粳亚种中的多态性能够肉眼分辨,平均覆盖的遗传距离为10.2cM,并挑选部分SSR标记评价籼粳交群体遗传背景,带型分辨的效果良好。该套标记将使SSR标记的应用更加广泛快捷。

关键词: 水稻, 籼粳交, SSR标记, 琼脂糖