河南农业科学 ›› 2016, Vol. 45 ›› Issue (2): 104-108.

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青天葵PAL基因序列特征和表达分析

黄琼林1,何 瑞2,3*,詹若挺2,3   

  1. 1.广东医学院,广东 湛江 524023; 2.广州中医药大学 中药资源科学与工程研究中心,广东 广州 510006;3.岭南中药资源教育部重点实验室,广东 广州 510006
  • 收稿日期:2015-08-20 出版日期:2016-02-15 发布日期:2016-02-15
  • 通讯作者: 何 瑞(1972-),女,广东广州人,研究员,博士,主要从事中药资源可持续利用研究。E-mail:ruihe@gzucm.edu.cn
  • 作者简介:黄琼林(1986-),男,广东湛江人,讲师,主要从事医学生物化学研究。E-mail:perfecthql@163.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30701090);广东省自然科学基金博士启动项目(2015A030310519)

  • Received:2015-08-20 Published:2016-02-15 Online:2016-02-15

摘要: 在前期完成的青天葵(Nervilia fordii)转录组测序数据的基础上,采用生物信息学方法对3个青天葵PAL基因家族成员(NfPAL1、NfPAL2 和NfPAL3)的cDNA序列及其编码蛋白质的氨基酸序列进行特征分析,并计算这些基因在青天葵叶片和球茎中的表达量。结果表明,从转录组数据中获得的3个青天葵PAL基因家族成员cDNA序列长度为1 743~2 091 bp,编码581~697个氨基酸。这些PAL基因编码包含苯丙氨酸解氨酶多功能域,并且不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性稳定蛋白。3个青天葵PAL基因在青天葵中的表达呈组织特异性,其中,NfPAL〖STBX〗1和NfPAL3在球茎中的表达量较高,而NfPAL2在叶片中具有较高的表达水平。

关键词: 苯丙氨酸解氨酶, 青天葵, 序列特征, 表达, 生物信息学