河南农业科学 ›› 2011, Vol. 40 ›› Issue (5): 161-163.

• 畜牧 兽医 • 上一篇    下一篇

鸡miR-181a 靶基因的生物信息学分析

孙桂荣, 张虎, 康相涛*, 陈其新, 李红, 王乐   

  1.  河南农业大学 牧医工程学院, 河南省家禽种质资源工程研究中心, 河南 郑州 450002
  • 收稿日期:2010-11-23 出版日期:2011-05-15 发布日期:2011-05-15
  • 通讯作者: 康相涛(1962-), 男, 河南南阳人, 教授, 博士, 主要从事地方鸡种质资源发掘创新与利用研究。 E-mail: xtkang2001@263.net
  • 作者简介:孙桂荣(1976-),女,河南沈丘人, 在读博士研究生, 研究方向: 家禽遗传育种.E-mail:grsun2000@126.com
  • 基金资助:
     国家自然科学基金项目(31072023);国家农业科技成果转化资金项目(2009GB2D000218);现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx41g05)

  • Received:2010-11-23 Published:2011-05-15 Online:2011-05-15

摘要: 对鸡miR-181a的靶基因进行了预测及相关生物信息学分析,为深入研究miR-181a生物学功能提供理论指导。利用TargetScan 5.1与PicTar 2种计算方法对miR-181a进行靶基因预测,交集的基因集合分别进行GO富集分析和KEGG分析。结果预测到交集靶基因有137个下游靶基因,GO富集分析结果表明,137个靶基因涵盖于生物学过程、细胞组成、分子功能3个分类。KEGG分析结果表明,靶基因富集于神经营养因子信号通路、长时程增强效应通路等与代谢有关的通路。 

关键词:  , 鸡, miR-181a, 通路分析, 生物信息学