百脉根PIN基因家族的鉴定与分析

河南农业科学 ›› 2019, Vol. 48 ›› Issue (8): 39-48.

百脉根PIN基因家族的鉴定与分析

吕赟¹，丘日光¹，杨仕梅¹，吴佳海²，宋莉¹

（1.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室，贵州贵阳 550025； 2.贵州省草业研究所，贵州贵阳 550006）

收稿日期:2019-02-16 出版日期:2019-08-15 发布日期:2019-08-15
通讯作者: 吴佳海（1969-），男，贵州松桃人，研究员，本科，主要从事草资源与育种应用研究。E-mail:1848266168@qq.com 宋莉（1971-），女，贵州纳雍人，教授，博士，主要从事植物基因工程研究。E-mail:lpsssl@126.com
作者简介:吕赟（1994-），男，湖南永州人，在读硕士研究生，研究方向：植物发育分子生物学。E-mail:1871022767@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目（31660685）；贵州省科技计划项目（［2017］1044，［2017］5788，［2016］4024）

Received:2019-02-16 Published:2019-08-15 Online:2019-08-15

摘要/Abstract

摘要：

生长素输出载体蛋白PIN-formed（PIN）是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件，与植物生长发育密切相关。利用生物信息学方法对百脉根（Lotus corniculatus）PIN基因家族成员（LjPIN）进行筛选、鉴定，并对其结构特征、系统进化、编码蛋白质性质、顺式作用元件组成和表达特性等进行研究，为其功能鉴定及利用奠定基础。结果表明，百脉根基因组中含有27个LjPIN成员，主要分布在1—5号染色体上；27个LjPIN基因含8个可变剪切位点，编码35个蛋白质；除了LjPIN4、LjPIN13、LjPIN23基因外，其他LjPIN基因均含有内含子，内含子数和外显子数均为1~10个；LjPIN与拟南芥AtPIN、大豆GmPIN在进化关系上较接近，与水稻OsPIN较远；LjPIN蛋白大多为碱性的两性稳定蛋白质，一般含有5种保守基序，基序数量2~9个；LjPIN基因除了含有顺式作用基本元件CAAT-box和TATA-box外，还含有光响应、激素响应及生长发育相关的调控元件；11个LjPIN基因在根、茎、叶、花和不同形成时期种子中呈时空差异表达。

吕赟，丘日光，杨仕梅，吴佳海，宋莉. 百脉根PIN基因家族的鉴定与分析[J]. 河南农业科学, 2019, 48(8): 39-48.

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