河南农业科学 ›› 2012, Vol. 41 ›› Issue (6): 148-151.

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不同物种Hsf2基因编码区生物信息分析

马建青,李祥龙*,周荣艳,李兰会,任玉红   

  1. 河北农业大学 动物科技学院,河北 保定 071001
  • 收稿日期:2012-01-15 出版日期:2012-06-15 发布日期:2012-06-15
  • 通讯作者: 李祥龙(1963-),男,河北丰南人,教授,博士,博士生导师,主要从事动物遗传育种研究。E-mail:lixianglongcn@yahoo.com
  • 作者简介:马建青(1988-),女,河北省邢台人,在读硕士研究生,研究方向:动物遗传。E-mail:majianqing2006@126.com
  • 基金资助:
     国家自然科学基金项目(31172196)

  • Received:2012-01-15 Published:2012-06-15 Online:2012-06-15

摘要: 采用比较基因组学和生物信息学方法,分析了人、黑猩猩、长臂猿、猕猴、狨、欧洲兔、大熊猫、野猪、牛、非洲象、褐家鼠、小家鼠、荷兰猪和灰仓鼠共14个物种的热休克转录因子2(或称热激因子2,heat shock transcription factor 2,HSF2)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对该基因的氨基酸序列、组成成分等进行预测和推断。结果表明,在来自14个物种的40条基因序列中共检测到多态位点数203个,其中有单一多态位点68个,百分率约为9.81%,检测到单体型17种,Hsf2基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现有较丰富的遗传多样性。Hsf2的氨基酸序列表现为亲水性,理论等电点大多小于7,表现为酸性;肽链的不稳定系数在51.90~58.13,表明多肽不稳定。 

关键词:  , 物种, 热休克转录因子Hsf2基因, 生物信息学