河南农业科学 ›› 2020, Vol. 49 ›› Issue (3): 157-166.DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.03.021
黄明捷1,2,3,张勇1,2,3,陈祥1,2,3,陈伟1,2,3,莫先艇1,2,3,郭勇1,2,3,王天松1,2,3
HUANG Mingjie1,2,3,ZHANG Yong1,2,3,CHEN Xiang1,2,3,CHEN Wei1,2,3,MO Xianting1,2,3,GUO Yong1,2,3,WANG Tiansong1,2,3
摘要: 为研究牛溶质载体13(SLC13)基因编码蛋白的结构和功能,运用生物信息学软件对牛SLC13蛋白的理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、序列保守基序、亚细胞定位、跨膜区进行分析,预测其蛋白质互作网络并构建不同物种SLC13基因家族编码蛋白的系统发育树。结果表明,牛SLC13蛋白的氨基酸数介于520~626个,亮氨酸含量最高,组氨酸含量最低,分子质量介于57.80~68.96 ku,其编码蛋白均为疏水性蛋白,除SLC13A2蛋白外的4个编码蛋白均为稳定蛋白。牛SLC13蛋白的二级结构主要由α-螺旋、β-转角以及无规卷曲组成,外显子数目介于11~16,除SLC13A3基因编码蛋白无Motif 10、SLC13A5基因编码蛋白无Motif 8外,其他编码蛋白序列均存在Motif 1—10,SLC13蛋白亚细胞定位于质膜、内质网和线粒体,SLC13A3蛋白在高尔基体中有少量分布。牛SLC13蛋白均为多次跨膜螺旋的内在膜蛋白,其以不同形式在生物学层面和分子功能层面发挥功能。系统进化分析发现,14个物种的SLC13A1、SLC13A4蛋白处于同一个较大分支,SLC13A2、SLC13A3和SLC13A5处于另一个较大分支,普通牛均与瘤牛、水牛、牦牛亲缘关系最近。
中图分类号: