河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (9): 131-137.

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中甸犏牛SLC11A1基因3′非翻译区多态位点研究及其与抗病性关联的评估

王利平1,2,席冬梅1,熊和丽1,李国治1,李 鹏2,邓卫东1*   

  1. (1.云南农业大学 动物科学技术学院,云南 昆明 650201; 2.新乡学院 生命科学与技术学院,河南 新乡 453000)
  • 收稿日期:2018-04-01 出版日期:2018-09-15 发布日期:2018-09-15
  • 通讯作者: 邓卫东(1972-),男,陕西石泉人,教授,博士,主要从事动物遗传资源开发利用与评价。E-mail:1692425306@qq.com
  • 作者简介:王利平(1980-),女,河南临颍人,讲师,博士,主要从事动物遗传资源开发利用与评价。E-mail:93612020@qq.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(31460583);云南省现代肉牛产业技术体系项目(2017KJTX0015)

  • Received:2018-04-01 Published:2018-09-15 Online:2018-09-15

摘要: 为研究中甸犏牛溶质载体转运蛋白基因(SLC11A1)的结构变异情况,并评估结构变异与抗病性的关联,采集了114个样品,扩增了SLC11A1基因3′非翻译区(3′UTR)部分序列,测序共检测到3个微卫星多态位点(MS1、MS2、MS3)和3个核苷酸变异(1 782位点T→G、1 805位点G→A、1 907位点G→T),其中MS1有6个等位基因(GT10、GT12、GT14—17)、MS2有3个等位基因(GT5—7)、MS3有5个等位基因(GT12—16)。GT12/15、GT5/5、GT13/13基因型频率最高,分别为0.204、0.05、0.324;GT15、GT5、GT13等位基因频率最高分别为0.284、0.685、0.433。对MS1、MS2、MS3这3个多态位点进行单倍型分析,发现了44种单倍型,其中GT12/5/13为优势单倍型,频率为0.13。χ2比较分析表明,中甸犏牛与婆罗门瘤牛×布兰科牛、荷斯坦牛×布兰科牛、布兰科牛、非洲牛MS1位点的GT12/12基因型频率差异显著(P<0.01),与西班牙黄牛、荷兰黄牛MS3的GT13/13基因型频率差异显著(P<0.01),与非洲黄牛差异不显著(P>0.05)。综上,中甸犏牛SLC11A1基因3′UTR具有丰富的多态性,推断其GT12/12和GT13/13纯合子基因型与抗病性相关。

关键词: SLC11A1基因; 中甸犏牛; 3&prime, UTR; 微卫星多态性(GT)n