摘要： 苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus, ASPV)是一种严重危害果树生产的潜隐性病毒，为了解ASPV的变异特点，基于已报道的ASPV外壳蛋白(coat protein, CP)基因核苷酸序列信息，结合RNA二级结构分析，对ASPV的变异进行分析，结果显示，不同分离物CP基因前半部分区域存在3个大段的空位区。中国分离物PR1在CP基因末端有12个核苷酸的序列插入，RNA二级结构预测显示，插入点附近能形成一个稳定的茎环结构，序列插入并未引起RNA二级结构的明显变化，重组分析显示，波兰分离物ST181为中国分离物WS和波兰分离物N1的重组体，系统进化分析支持该重组事件的发生。ASPV核苷酸序列变异复杂，并能够发生重组，因而有必要收集更多抗性资源，加强抗病育种。

关键词: 苹果茎痘病, 变异, 重组, RNA二级结构