摘要： 为选择适合苜蓿基因组检测的分子标记，以19份国内外苜蓿种质为材料，比较分析了ISSR、SCoT、RAPD 3种标记在苜蓿基因组中的检测效率。结果表明，不同分子标记检测效率差异较大，引物筛选率以RAPD标记最高，达到41.18%；扩增总条带数和多态性条带数均以RAPD标记最多，多态性条带百分比以ISSR最高，为 96.25%；SCoT标记的有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数值均高于ISSR、RAPD标记。可见，不同分子标记在不同检测指标方面各有优劣，应综合应用。

关键词: 苜蓿, 分子标记, 检测效率