Journal of Henan Agricultural Sciences ›› 2016, Vol. 45 ›› Issue (2): 104-108.
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黄琼林1,何 瑞2,3*,詹若挺2,3
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摘要: 在前期完成的青天葵(Nervilia fordii)转录组测序数据的基础上,采用生物信息学方法对3个青天葵PAL基因家族成员(NfPAL1、NfPAL2 和NfPAL3)的cDNA序列及其编码蛋白质的氨基酸序列进行特征分析,并计算这些基因在青天葵叶片和球茎中的表达量。结果表明,从转录组数据中获得的3个青天葵PAL基因家族成员cDNA序列长度为1 743~2 091 bp,编码581~697个氨基酸。这些PAL基因编码包含苯丙氨酸解氨酶多功能域,并且不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性稳定蛋白。3个青天葵PAL基因在青天葵中的表达呈组织特异性,其中,NfPAL〖STBX〗1和NfPAL3在球茎中的表达量较高,而NfPAL2在叶片中具有较高的表达水平。
关键词: 苯丙氨酸解氨酶, 青天葵, 序列特征, 表达, 生物信息学
黄琼林,何 瑞,詹若挺. 青天葵PAL基因序列特征和表达分析[J]. 河南农业科学, 2016, 45(2): 104-108.
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