Journal of Henan Agricultural Sciences ›› 2012, Vol. 41 ›› Issue (1): 65-68.
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殷全玉1,2,郭夏丽1,赵铭钦2,王岩1*
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摘要: 为了优化以土壤微生物DNA为模板的PCR反应条件,采用E.Z.N.A.soil DNA kit试剂盒提取土壤微生物总DNA,对16SrDNA V3可变区的PCR反应体系和反应条件进行优化。主要从DNA模板用量、引物浓度、退火温度、热启动方式4个方面进行筛选试验,最后得出最适宜的土壤DNA扩增体系为:10.5ng模板DNA、5μL 10×buffer、4μL 2.5mmol/L dNTP、10μmol/L引物各1.5μL,2.5UTaq酶,加无菌ddH2O补足至50μL;PCR循环程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,52℃退火1min,72℃延伸70s,29个循环;72℃延伸5min。试验结果表明:选择热启动方式和合适的退火温度是获得高质量PCR产物的关键。
关键词: 土壤微生物DNA, 16S rDNA, V3区, PCR扩增, 优化, 热启动方式, 退火温度
殷全玉,郭夏丽,赵铭钦,王岩. 土壤微生物总DNA的V3可变区PCR反应体系优化[J]. 河南农业科学, 2012, 41(1): 65-68.
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