大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析

吴卓晶; 庞保平; 傅永福

doi:10.3969/j.issn.1004-3268.2010.08.006

河南农业科学 >

2010 , Vol. 39 >Issue 8: 22 - 32

DOI: https://doi.org/10.3969/j.issn.1004-3268.2010.08.006

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大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析

吴卓晶 ,
庞保平 ,
傅永福

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¹内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010019;²中国农业科学院作物科学研究所,北京100081

网络出版日期: 2010-08-15

基金资助

国家863计划（2007AA10Z119 ；2006AA10A111）

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摘要

利用Phytome、TAIR、NCBI网站及其数据库和MEGA 4.0、Clustal X软件,对大豆（Gly-cine max）基因组中TOC1同源基因进行了生物信息学分析,确定了GmTOC1基因及其在染色体上的物理分布、内含子-外显子结构,进行了氨基酸序列比对,并研究了其系统发育学地位。结果表明,GmTOC1与AtTOC1亲缘关系较近,都具有保守的调节区域,而且可能具有相似的生物钟调控功能。此外发现,大豆基因组中含有4个拷贝的TOC1同源基因,它们在生物进化过程中保留了与拟南芥同源的结构和功能。

关键词： 大豆; TOC1; 生物钟; 开花; 系统发育

本文引用格式

吴卓晶 , 庞保平 , 傅永福 . 大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2010 , 39(8) : 22 -32 . DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2010.08.006

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