棉花SBP家族基因的鉴定与分析

河南农业科学 ›› 2019, Vol. 48 ›› Issue (03): 39-48.

棉花SBP家族基因的鉴定与分析

郑玲,张欢欢,张延召

洛阳师范学院生命科学学院，河南洛阳 471000

收稿日期:2018-10-11 出版日期:2019-03-15 发布日期:2019-03-15
作者简介:郑玲（1981-），女，河南南阳人，讲师，硕士，主要从事植物学研究。E-mail:linda2266@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目(31400602)；河南省科技攻关项目(172102310054)

Received:2018-10-11 Published:2019-03-15 Online:2019-03-15

摘要/Abstract

摘要： 为研究棉花Squamosa启动子结合蛋白（SBP）家族成员的结构和功能，利用生物信息学方法，从棉花全基因组数据库中筛选并鉴定出83个棉花SBP家族成员，命名为 GhSBP1—GhSBP83。并对该家族成员的蛋白质理化性质、多序列比对、系统进化树、基因染色体分布、基因结构、基因表达模式进行了全面分析。结果表明，棉花SBP 转录因子家族可以分为8个亚族。棉花SBP基因分布在1—8号染色体以及11—13号染色体上。对NCBI中陆地棉的EST数据库进行比对分析，结果显示，40个棉花SBP转录因子家族成员在棉花的分生组织、茎、花、花芽、花药以及棉纤维中广泛表达。其中，GhSBP2、GhSBP4、GhSBP6等20多个基因在花药和棉纤维中均有表达，推测花药和棉纤维的生长发育可能同时受这些基因的控制。

郑玲,张欢欢,张延召. 棉花SBP家族基因的鉴定与分析[J]. 河南农业科学, 2019, 48(03): 39-48.

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