%0 Journal Article %A 陈泽斌 %A 高 熹 %A 郭丽红 %A 靳 松 %A 李 冰 %A 王定斌 %T 铁皮石斛不同部位内生细菌群落高通量分析 %D 2017 %R %J 河南农业科学 %P 98-102 %V 46 %N 11 %X 为揭示铁皮石斛不同器官中内生细菌的分布规律,应用Illumina测序平台的MeSiq高通量测序仪对铁皮石斛根、茎、叶中内生细菌的16S rDNA-V4区扩增子进行测序,对测得数据进行生物信息学分析,评价物种Alpha多样性和Beta多样性。经FLASH软件对序列进行拼接,茎、叶、根样品分别获得64 851、77 499、52 157条原始序列,经Qiime软件过滤,再剔除宿主的叶绿体和线粒体序列,最终分别得到64 742、77 351、52 064条有效序列,在97%的序列相似性水平上,这些有效序列被Uparse软件划分为61、134、112个操作分类单元(OTUs)。序列比对结果表明,假单胞菌属(Pseudomonas)和食酸菌属(Acidovorax)细菌在根、茎、叶中都是优势菌,瘤胃球菌属(Ruminococcus)、Faecalibacterium属、甲基杆菌属(Methylobacterium)、希瓦氏菌属(Shewanella)细菌表现出组织专一性,丰度聚类分析及主成分分析表明,根和叶中内生细菌群落结构最为相似。铁皮石斛植株内蕴含丰富的细菌资源,其分布受组织结构及成分因素影响表现出器官差异性。 %U http://www.hnnykx.org.cn/CN/abstract/article_7637.shtml