河南农业科学 ›› 2013, Vol. 42 ›› Issue (2): 15-19,25.

• 作物栽培 遗传育种 • 上一篇    下一篇

小麦F-box蛋白基因的电子克隆和生物信息学分析

王俊生,李俐俐,杨欢,谭光轩,殷贵鸿   

  1. 周口师范学院 生命科学系,河南 周口 466001
  • 收稿日期:2012-07-09 出版日期:2013-02-15 发布日期:2013-02-15
  • 作者简介:王俊生(1970-),男,陕西蒲城人,副教授,博士,主要从事小麦雄性不育与油菜遗传育种研究。E-mail:wjs0099@163.com
  • 基金资助:
    周口师范学院大学生创新基金(2012DXS024)

  • Received:2012-07-09 Published:2013-02-15 Online:2013-02-15

摘要: 为探讨F-box蛋白在小麦发育过程中的调节作用,利用电子克隆技术获得了一个小麦F-box蛋白基因,采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,小麦F-box蛋白由362个氨基酸组成,在N端和C端分别存在一个F-box保守结构域和一个DUF295保守结构域(功能未知),该蛋白质二级结构中以α-螺旋(23.48%)、扩展束(25.41%)和无规则卷曲(47.24%)为主,在94-115位点处可能存在一个由内向外的跨膜区,N端不存在信号肽序列,亚细胞定位于细胞质中;该F-box蛋白与二穗短柄草、玉米和水稻的F-box蛋白相似性较高,进化距离较近。

关键词: 小麦, F-box蛋白基因, 电子克隆, 生物信息学