河南农业科学

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小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析

徐 武1,刘建丰2,张 戈3,徐 文3,袁祖丽1   

  1. (1. 河南农业大学 生命科学学院,河南 郑州 450002;2. 河南省农业科学院 农业经济与信息研究所,河南 郑州 450002; 3. 河南省农业科学院 作物设计中心,河南 郑州 450002)
  • 收稿日期:2019-05-10
  • 通讯作者: 袁祖丽(1963-),女,河南南阳人,教授,博士,主要从事土壤重金属污染修复研究。E-mail:zuliyuan@126.com
  • 作者简介:徐 武(1990-),男,河南息县人,在读硕士研究生,研究方向:小麦分子生物学。E-mail:1285517656@qq.com
  • 基金资助:
    河南省基础与前沿技术研究计划项目(162300410153)

  • Received:2019-05-10

摘要: 对小麦几丁质酶基因家族成员进行鉴定, 并对其基因结构、保守基序、染色体分布、系统进化及禾谷镰刀菌胁迫下的表达水平进行分析,为进一步研究几丁质酶基因在小麦应答各种生物胁迫和抗病分子育种奠定基础。结果表明,从小麦基因组中共鉴定到159个几丁质酶基因,分布在21条染色体上;小麦几丁质酶基因家族成员分为5类,隶属于GH-18和GH-19两个亚家族。GH-18亚家族包括III、V类,分别含有34、48个基因;GH-19亚家族包括I、II、IV类,分别包含52、13、12个基因。同一亚家族的成员聚类在同一分支上,并且具有相似的外显子-内含子基因结构和保守基序。在4个小麦品系被禾谷镰刀菌侵染后几丁质酶基因家族一些成员的表达均显著上调。

关键词: 小麦, 几丁质酶基因家族, 全基因组鉴定, 禾谷镰刀菌, 表达模式