河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (11): 134-141.

• 畜牧·兽医 • 上一篇    下一篇

溶藻弧菌TolB蛋白的生物信息学分析

伍娜娜1,2,康 超1,2,荣 娜1,2,刘 祥1,2*,陈春琳1,2,陈 琛1,2,丁 锐1,2,吴三桥1,2   

  1. (1.陕西理工大学 生物科学与工程学院/中德天然产物研究所,陕西 汉中 723001;2.陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心,陕西 汉中723001)
  • 收稿日期:2018-06-21 出版日期:2018-11-15 发布日期:2018-11-15
  • 通讯作者: 刘 祥(1983-),男,安徽合肥人,副教授,博士,主要从事蛋白质组学与免疫学研究。E-mail:liuxiang888525@163.com
  • 作者简介:伍娜娜(1994-),女,陕西西安人,在读硕士研究生,研究方向:分子生物学。E-mail:wunana0413@163.com
  • 基金资助:
    陕西理工大学人才项目(SLGQD1803);陕西省教育厅科学研究计划项目(17JK0137);国家外国专家局项目(GDT20186100426)

  • Received:2018-06-21 Published:2018-11-15 Online:2018-11-15

摘要: 对溶藻弧菌转运蛋白(TolB)进行结构和功能进行分析,设计其表位多肽重组疫苗,以提高溶藻弧菌TolB蛋白的免疫效果,运用生物信息学方法对溶藻弧菌TolB蛋白的系统进化关系、理化性质、高级结构和细胞抗原表位进行分析。进化关系结果显示,溶藻弧菌的TolB蛋白与副溶血性弧菌、霍乱弧菌和费氏弧菌的TolB蛋白具有较高同源性,溶藻弧菌TolB蛋白可能对这4种菌株的感染起到交叉免疫保护作用。溶藻弧菌TolB蛋白为亲水性蛋白,1—22位氨基酸为其信号肽位置,无跨膜结构并定位于细胞膜外;溶藻弧菌TolB蛋白二级结构中以无规则卷曲(40.00%)、α-螺旋(18.67%)和β-转角(11.33%)为主。溶藻弧菌TolB蛋白可能存在4个优势B细胞抗原表位,1个细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位,1个辅助T细胞(Th)抗原表位,并重组拼接获得抗原性较好的TolB蛋白表位多肽。

关键词: 溶藻弧菌, TolB蛋白, 表位疫苗, 抗原分析, 生物信息学分析