菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析

河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (7): 59-66,89.

菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析

付苏宏，雷鸣，张勇群^*，施静，郝豆豆

(西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室，四川成都 610041)

收稿日期:2018-02-28 出版日期:2018-07-15 发布日期:2018-07-15
通讯作者: 张勇群（1976-），女，四川成都人，副教授，博士，主要从事藏药材基因与功能研究。E-mail：yongqunzhang@yahoo.com
作者简介:付苏宏（1993-），女，四川内江人，硕士，主要从事分子生物学研究。E-mail：fusuhong11@163.com
基金资助:
西藏自治区科技厅自然科学基金项目（2015ZR-13-5）

Received:2018-02-28 Published:2018-07-15 Online:2018-07-15

摘要/Abstract

摘要： 采用生物信息学的方法分析菊叶香藜3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（DsHMGR）基因所编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、保守结构域、二级结构、三级结构，并进行多条氨基酸序列比对和系统进化树构建。结果表明，DsHMGR基因包含一段1 725 bp的开放阅读框，编码574个氨基酸，非极性氨基酸为主要氨基酸，等电点为7.46，为不稳定蛋白质，编码蛋白质中不含有信号肽，在N端具有2个疏水区域，含有2个跨膜结构域,DsHMGR蛋白定位到内质网上，在C端和连接区具有较高保守性，在N端保守性较低，含有HMGR蛋白特有的4个保守活性位点，二级结构主要为α-螺旋，三级结构预测显示DsHMGR蛋白具有N、L和S 3个催化活性中心结构域。HMGR蛋白进化分析中，菊叶香藜与藜科植物聚为一支，遗传距离较近。

关键词: 菊叶香藜, 萜类化合物, 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（HMGR）, 生物信息学

付苏宏，雷鸣，张勇群，施静，郝豆豆. 菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析[J]. 河南农业科学, 2018, 47(7): 59-66,89.

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