河南农业科学 ›› 2018, Vol. 47 ›› Issue (5): 129-134.

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鸡碳酸酐酶4的生物信息学分析

郭玉琦,刘辰晖,刘桂琼*,姜勋平,刘 耘   

  1. (华中农业大学 动物科学技术学院,湖北 武汉 430070)
  • 收稿日期:2017-10-31 出版日期:2018-05-15 发布日期:2018-05-15
  • 通讯作者: 刘桂琼(1970-),女,四川简阳人,副教授,博士,主要从事畜禽分子遗传和功能基因组学研究。E-mail:liuguiqiong@mail.hzau.edu.cn
  • 作者简介:郭玉琦(1993-),女,湖北武汉人,在读硕士研究生,研究方向:禽类功能基因组学。E-mail:kellyguo@webmail.hzau.edu.cn
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(31572404)

  • Received:2017-10-31 Published:2018-05-15 Online:2018-05-15

摘要: 为进一步研究和探索碳酸酐酶4(CAⅣ)的结构和功能,采用生物信息学软件预测并分析鸡CAⅣ的理化性质、结构特征和功能域。结果表明,鸡CAⅣ由316个氨基酸构成,是亲水性较强的膜结合蛋白,二级结构上α螺旋和β折叠较多,且抗原表位丰富,存在信号肽,有可能是细胞膜成分之一。CAⅣ蛋白有多个丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点及3个酪氨酸磷酸化位点,并且第165位的天冬酰胺可能为糖基化位点。进化分析发现,鸡CAⅣ与火鸡的氨基酸序列相似性最高,其后依次是珍珠鸡、鹌鹑、大雁和绿头鸭,这些物种在进化的过程中关系密切,也说明鸡CAⅣ在生物进化过程中的序列保守性较强。

关键词: 鸡, 碳酸酐酶4, 蛋白质结构, 功能预测, 生物信息学