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猪源大肠杆菌氟苯尼考耐药基因SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测试剂盒的研制

  

  1. (贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州 贵阳 550005)
  • 收稿日期:2017-05-24 出版日期:2017-11-15 发布日期:2017-11-15
  • 作者简介:余 波(1981-),男,四川邻水人,副研究员,硕士,主要从事兽医微生物与中兽药研究。
  • 基金资助:
    贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY[2015]3009-2号);贵州省重大科技专项(黔科合重大专项字[2013]6014号);贵州省科学技术基金项目(黔科合LH字[2014]7694号)

  • Received:2017-05-24 Published:2017-11-15 Online:2017-11-15

摘要: 根据GenBank中猪源大肠杆菌氟苯尼考耐药基因floR的序列设计1对特异性引物,扩增出floR基因片段,克隆到pMD-18T载体上,构建pMD-18T-floR阳性标准质粒。通过SYBR GreenⅠ荧光定量PCR反应条件的优化、荧光定量PCR标准曲线的建立、熔解曲线的分析及敏感性、特异性、重复性试验,建立针对猪源大肠杆菌氟苯尼考耐药基因floR的荧光定量PCR检测方法,并研制出检测试剂盒,同时对从养殖场分离的156株大肠杆菌进行耐药表型和耐药基因检测。结果显示,研制试剂盒灵敏度可达1.0×101拷贝,重复性好,特异性强,对大肠杆菌磺胺类耐药菌株、β-内酰胺类耐药菌株、大环内酯类耐药菌株检测均为阴性,熔解曲线分析扩增产物的溶解温度为88.8~89.2 ℃,没有引物二聚体和非特异性扩增峰出现,耐药表型和耐药基因检测符合率为96.7%。表明研制的试剂盒适合于猪源大肠杆菌氟苯尼考耐药基因临床样品的检测。

关键词: 大肠杆菌, 氟苯尼考, floR基因, SYBR GreenⅠ荧光定量