河南农业科学 ›› 2017, Vol. 46 ›› Issue (3): 34-40.

• 作物栽培·遗传育种 • 上一篇    下一篇

大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析

钟 静1,2,吴小明1,胡 颖2   

  1. 1.湖北第二师范学院/植物抗癌活性物质提纯与应用湖北省重点实验室,湖北 武汉 430205;2.武汉大学/杂交水稻国家重点实验室,湖北 武汉 430072
  • 收稿日期:2016-08-23 出版日期:2017-03-15 发布日期:2017-03-15
  • 作者简介:钟 静(1979-),女,湖北荆州人,讲师,博士,主要从事发育生物学研究。E-mail:jjing2003_1@163.com
  • 基金资助:
    Trans助研梦想基金项目(Trans-RasDF-019)

  • Received:2016-08-23 Published:2017-03-15 Online:2017-03-15

摘要: 基于已公布的大豆基因组数据库,鉴定大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclinlike arabinogalactan proteins,FLAs)基因,并对其基本理化性质、保守基序、功能域、系统发生树、蛋白质二级结构等进行综合分析。结果显示,从大豆基因组中共鉴定出33个FLAs,其编码的蛋白质氨基酸长度在237~455 aa,分子质量在25.483 0~50.578 5 ku,理论等电点在4.33~9.56。亚细胞定位分析显示,GmFLAs均定位在质膜上(其中GmFLA4/25也可定位在叶绿体中)。GmFLAs含有1~2个该家族的保守成束蛋白质结构域(fasciclin domains,FAS)。系统进化分析显示,大豆和拟南芥FLAs的同源性不高。GmFLAs二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等元件组成,其中,延伸链的比例最低,无规则卷曲比例最高。

关键词: 大豆, 类成束阿拉伯半乳糖蛋白, 理化性质, 结构特征, 生物信息学分析