河南农业科学 ›› 2009, Vol. 38 ›› Issue (9): 161-166.DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2009.09.040

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玫瑰GASA4-like基因的克隆及其序列分析

张强;孟月娥;李艳敏;王慧娟;王利民;王志勇   

  1. 河南省农业科学院园艺研究所,河南郑州450002
  • 出版日期:2009-09-15 发布日期:2009-09-15
  • 基金资助:
    河南省基础与前沿技术研究计划项目(082300430100)

  • Published:2009-09-15 Online:2009-09-15

摘要: 从大马士革玫瑰(Rosa damascena)中利用同源克隆结合RACE的方法首次获得了一个GASA4-like基因的cDNA和DNA序列全长(GenBank登陆号FJ595792,FJ595793),并利用TAIL—PCR的方法克隆了其部分启动予序列。结果表明,玫瑰GASA4-like基因包含4个外显子,3个内含子,开放阅读框为327bp,编码108个氨基酸序列。对推导的氨基酸序列分析发现,N末端1~26个氨基酸是一信号肽序列,c末端含有12个保守的半胱氨酸残基,具有GASA基因家族共同的一些结构特征。系统进化分析表明,玫瑰GASA4-like与分生组织中表达的GAsA蛋白聚为一类。启动子顺式作用调控元件分析表明,GASA4-like基因上游318bp的部分启动子含有诱导表达调控元件和一些转录因子的结合位点;最后,对GASA4-like基因可能的生物学功能进行了预测。

关键词: 玫瑰, GASA4-like, 克隆, 序列分析

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