河南农业科学 ›› 2016, Vol. 45 ›› Issue (6): 130-136.

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兰州鲇G-SSR和EST-SSR在鲇形目和鲤形目鱼类中的通用性研究

杨忠礼1,2,连总强2,3,吴旭东1,2,3*,俞兆曦1,王 燕2,肖 伟2,3,赛清云2,3   

  1. 1.甘肃农业大学 动物科学技术学院,甘肃 兰州730070; 2.宁夏回族自治区水产研究所,宁夏 银川750001; 3.宁夏渔业工程技术研究中心,宁夏 银川750001
     
  • 收稿日期:2015-12-28 出版日期:2016-06-15 发布日期:2016-06-15
  • 通讯作者: 吴旭东(1967-),男,宁夏银川人,研究员,博士,主要从事水生动物分子生物学及种质资源保护与增养殖研究。E-mail:amy95@126.com
  • 作者简介:杨忠礼(1990-),男,甘肃合水人,在读硕士研究生,研究方向:淡水经济动物生物学及增养殖。E-mail:yang2009191048@163.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(31360633);宁夏对外科技合作项目;国家科技支撑计划项目(2012BAD25B09)

  • Received:2015-12-28 Published:2016-06-15 Online:2016-06-15

摘要: 为研究兰州鲇G-SSR和EST-SSR在鲇形目和鲤形目鱼类中的通用性,以12种不同鱼类为试验材料,分别采用改进的酚-氯仿法结合DNA产物纯化试剂盒法、传统酚-氯仿法、试剂盒法提取其尾鳍基因组DNA,对提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计检测。结果表明,改进的酚-氯仿法结合DNA产物纯化试剂盒法提取的鱼类基因组DNA 在纯度和稳定性方面明显优于传统酚-氯仿法、试剂盒法,且电泳条带清晰、整齐、明亮,操作简单,耗时短,便于快速、批量提取。利用兰州鲇14对G-SSR引物和21对EST-SSR引物在12种鱼类中进行跨目通用性分析,结果显示,兰州鲇G-SSR和EST-SSR在鲇形目、鲤形目鱼类的通用率分别为63.10%、32.14%和61.11%、44.44%,表明随着物种间亲缘关系变远,其通用性随之降低。

关键词: 基因组DNA, 兰州鲇, 鲇形目, 鲤形目, G-SSR, EST-SSR, 通用性