河南农业科学 ›› 2010, Vol. 39 ›› Issue (8): 22-32 .DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2010.08.006

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大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析

吴卓晶1,2;庞保平1;傅永福2   

  1. 1内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010019;2中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 出版日期:2010-08-15 发布日期:2010-08-15
  • 基金资助:
    国家863计划(2007AA10Z119 ;2006AA10A111)

  • Published:2010-08-15 Online:2010-08-15

摘要: 利用Phytome、TAIR、NCBI网站及其数据库和MEGA 4.0、Clustal X软件,对大豆(Gly-cine max)基因组中TOC1同源基因进行了生物信息学分析,确定了GmTOC1基因及其在染色体上的物理分布、内含子-外显子结构,进行了氨基酸序列比对,并研究了其系统发育学地位。结果表明,GmTOC1与AtTOC1亲缘关系较近,都具有保守的调节区域,而且可能具有相似的生物钟调控功能。此外发现,大豆基因组中含有4个拷贝的TOC1同源基因,它们在生物进化过程中保留了与拟南芥同源的结构和功能。

关键词: 大豆, TOC1, 生物钟, 开花, 系统发育

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