河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (6): 98-102.

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灰葡萄孢菌Racl基因的生物信息学分析

  

  1. 1.贵阳市白云区农业水利局,贵州 贵阳 550014;2.贵州师范大学 生命科学学院,贵州 贵阳 550001
  • 收稿日期:2013-11-02 出版日期:2014-06-15 发布日期:2014-06-15
  • 通讯作者: 张传博(1978-)男,山东凉山人,教授,博士,主要从事植物病虫害生物防治研究。E-mail:zhangchuanbo2004@163.com
  • 作者简介:兰俊(1981-)男,贵州贵阳人,助理农艺师,本科,主要从事植物病虫害防治研究。E-mail:19714857@qq.com
  • 基金资助:
      国家自然科学基金项目(31000881);贵州省星火计划项目[黔科合农字(2012)5056号]

  • Received:2013-11-02 Published:2014-06-15 Online:2014-06-15

摘要: 利用多种不同序列分析软件,基于生物基因组学数据库,对灰葡萄孢菌Racl基因进行生物信息学分析,以预测BCRac1基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建Racl基因同源系统进化树。结果表明:BCRac1基因编码产物由150个氨基酸构成,为亲水性蛋白,没有信号肽,二级结构以a-螺旋与无规则卷曲为主,推测其主要在细胞核中发挥生物学作用。结构功能域分析表明,BCRac1基因编码产物可能主要具有生长因子的功能,对灰葡萄孢菌的激素调节有影响。构建的Rac1基因编码产物系统进化树显示,BCRac1基因与核盘菌、稻瘟病菌、炭疽菌等物种Rac1基因遗传距离较近,具有高度同源性。

关键词: 灰葡萄胞菌,  , Rac1基因, 生物信息学