河南农业科学 ›› 2009, Vol. 38 ›› Issue (8): 78-83.DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2009.08.021

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黄瓜黑星病菌核糖体基因ITS区段的克隆及序列分析

高永洋;高观朋;王倩倩;王伟;   

  1. 华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室;
  • 出版日期:2009-08-15 发布日期:2009-08-15
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30871664);上海市重点攻关项目(08391911400);上海市农转资金项目(073419N09)

  • Published:2009-08-15 Online:2009-08-15

摘要: 为了探讨枝孢霉属的系统发育情况,采用真菌核糖体基因转录间隔区域(ITS)通用引物,PCR扩增3株来自不同地方的黄瓜黑星病菌核糖体基因的ITS序列,并对PCR产物进行测序和序列分析。结果表明:3株黄瓜黑星病菌之间同源性为100%,ITS全长463bp,其中ITS1长154bp,5.8S rDNA长159bp,ITS2长150bp,各碱基的个数分别为G 119个、C 118个、A 120个、T 106个,GC含量为51.2%。利用MEGA4软件中的NJ法和ME法,对3个样品序列以及GenBank中登陆的枝孢霉属其他25个种构建ITS聚类分析树状图,NJ法和ME法构建的结果基本相同,枝孢霉属可以分为5个聚类组,所测的3个样品和Cladosporium cucumerinum在一个聚类组中。

关键词: 黄瓜黑星病菌, 核糖体基因转录间隔区, 聚类组

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