河南农业科学 ›› 2011, Vol. 40 ›› Issue (11): 38-42.

• 作物栽培 遗传育种 • 上一篇    下一篇

拟南芥和水稻UXS 基因家族生物信息学分析

潘玉欣,王巍杰,胡金山   

  1. 河北联合大学,河北 唐山 063009
  • 收稿日期:2011-05-21 出版日期:2011-11-15 发布日期:2011-11-15
  • 作者简介:潘玉欣(1979-),女,河北沧州人,讲师,博士,主要从事棉花遗传育种研究工作。E-mail:panyu-xin@163.com
  • 基金资助:
     河北省青年自然基金(C2010000919);唐山市科技局项目(1014020C-4);河北理工大学博士自然基金

  • Received:2011-05-21 Published:2011-11-15 Online:2011-11-15

摘要: 以6个拟南芥和6个水稻UXS基因家族序列为目标,对其基因结构、保守结构域、基因表达、系统进化等方面进行了综合分析。结果显示,12个UXS基因均有内含子,除OsUXS1基因仅在愈伤组织中表达外,其余11个基因在根、叶以及愈伤组织均有表达。12个UXS基因编码蛋白均存在较大范围的亲水区,有较强的亲水性。12个蛋白结构保守性较强,含有该基因家族的保守域3Beta-HSD和NAD-binding,分成2个亚家族,家族内结构相似的基因功能较为相似。综合分析表明,UXS是一个多基因家族,基因表达范围广,结构保守性强。

关键词:  , 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脱羧酶, 拟南芥, 水稻, 生物信息学, 结构与功能预测