河南农业科学 ›› 2011, Vol. 40 ›› Issue (9): 81-85.

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芝麻NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与分析

高树广1,2,刘红彦2,3*,王俊美2,3,倪云霞2,3,田保明1   

  1. 1.郑州大学 生物工程系,河南 郑州 450001;2.河南省农业科学院 植物保护研究所,河南 郑州 450002;3.河南省农作物病虫害防治重点实验室,河南 郑州 450002
  • 收稿日期:2011-03-04 出版日期:2011-09-15 发布日期:2011-09-15
  • 通讯作者: 刘红彦(1964-),男,河南嵩县人,研究员,博士,主要从事植物病理学研究。E-mail:liuhy1219@163.com
  • 作者简介:高树广(1985-),男,河南西华人,在读硕士研究生,研究方向:植物抗病遗传。E-mail:shuguanggao2008@163.com
  • 基金资助:
    国家芝麻产业技术体系(nycytx-20-1-05)

  • Received:2011-03-04 Published:2011-09-15 Online:2011-09-15

摘要:  分离和分析芝麻抗、感茎点枯病材料的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),可以为芝麻抗茎点枯病相关基因的克隆奠定基础。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域,合成了1对简并引物和2对特异引物,对6个抗茎点枯病芝麻品种中的抗病基因进行扩增,结果得到11条抗病基因同源序列。BLAST X分析发现,获得的11条RGAs与已知的RGAs有较高的相似性,氨基酸相似性为42%~57%。聚类分析将其分成5个亚类,均属于non-TIR-NBS-LRR类抗病基因。其氨基酸序列都不同程度地含有NBS保守区的典型特征基序,其中P-loop-GLPL区域氨基酸序列与已知抗病基因对应区域的相似性为18.2%~49.7%。

关键词: 芝麻, 茎点枯病, NBS-LRR, 抗病基因同源序列